RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 KRT28Q7Z3Y7 464 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 PXDNQ92626 1479 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 GNAI3P08754 354 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 ST5P78524 1137 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 USP26Q9BXU7 913 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 V9GYY5 206 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
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TRPS1-209ENST00000519674 BTBD11A6QL63 1104 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 PTGS1P23219 599 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 GPS2Q13227 327 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-209ENST00000519674 CEP135Q66GS9 1140 aa9.96□□□□□ -0.81
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TRPS1-209ENST00000519674 ANXA1P04083 346 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 CEP89Q96ST8 783 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 TCHHQ07283 1943 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 LMO7Q8WWI1 1683 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 C1orf167Q5SNV9 1468 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
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TRPS1-209ENST00000519674 MCTP2Q6DN12 878 aa9.96□□□□□ -0.82
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TRPS1-209ENST00000519674 USP44Q9H0E7 712 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 ATP6V1AP38606 617 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 SEMA3FQ13275 785 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 RGPD5Q99666 1765 aa9.95□□□□□ -0.82
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TRPS1-209ENST00000519674 MX1P20591 662 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 CLCN6P51797 869 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.95□□□□□ -0.82
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TRPS1-209ENST00000519674 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 PDE1AP54750 535 aa9.94□□□□□ -0.82
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TRPS1-209ENST00000519674 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 PLCD4Q9BRC7 762 aa9.94□□□□□ -0.82
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TRPS1-209ENST00000519674 LRMPQ12912 555 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 CASC1Q6TDU7 716 aa9.93□□□□□ -0.82
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TRPS1-209ENST00000519674 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 KIF1AQ12756 1690 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 HOXB7P09629 217 aa9.93□□□□□ -0.82
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TRPS1-209ENST00000519674 MAP2K2P36507 400 aa9.93□□□□□ -0.82
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TRPS1-209ENST00000519674 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 PPM1EQ8WY54 764 aa9.93□□□□□ -0.82
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TRPS1-209ENST00000519674 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-209ENST00000519674 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-209ENST00000519674 CCDC186Q7Z3E2 898 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 USP48Q86UV5 1035 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 DNAAF4Q8WXU2 420 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 EXOC4Q96A65 974 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 ACTN2P35609 894 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-209ENST00000519674 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa9.91□□□□□ -0.82
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