RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 COPS6Q7L5N1 327 aa23.63■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 NECTIN2Q92692 538 aa23.63■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 MAP2K2P36507 400 aa23.62■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.62■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 SP8Q8IXZ3 490 aa23.61■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.61■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.61■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.6■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 NEUROD2Q15784 382 aa23.6■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.6■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.6■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.6■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 SHTN1A0MZ66 631 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 CHL1O00533 1208 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 BBOX1O75936 387 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 RAD17O75943 681 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 SLC34A2O95436 690 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 KRT24Q2M2I5 525 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 NLRP10Q86W26 655 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 MPNDQ8N594 471 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 COL4A1P02462 1669 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.58■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 YDJCA8MPS7 323 aa23.58■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 RGS19P49795 217 aa23.58■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 TCIRG1Q13488 830 aa23.58■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.58■■□□□ 1.37
ITGA3-215ENST00000515147 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.57■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 GRAPQ13588 217 aa23.55■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 RUNDC1Q96C34 613 aa23.55■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 ZIC5Q96T25 663 aa23.55■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 TNIP1Q15025 636 aa23.54■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 DLK2Q6UY11 383 aa23.54■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.54■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.54■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.54■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.54■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.53■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 CA12O43570 354 aa23.52■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.52■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF428Q96B54 188 aa23.52■■□□□ 1.36
ITGA3-215ENST00000515147 SCN9AQ15858 1988 aa23.51■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.51■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 MICALL2Q8IY33 904 aa23.51■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.51■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.5■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 EGFRP00533 1210 aa23.49■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 HOXB7P09629 217 aa23.49■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.49■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 USP48Q86UV5 1035 aa23.49■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 PSMD14O00487 310 aa23.48■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.48■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 DPF2Q92785 391 aa23.48■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 H7C1D1 291 aa23.47■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 TMC4Q7Z404 712 aa23.47■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 CFAP44Q96MT7 982 aa23.47■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.47■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.46■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 HUNKP57058 714 aa23.46■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 NOGQ13253 232 aa23.46■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 FAM89AQ96GI7 184 aa23.46■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.46■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.46■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.45■■□□□ 1.35
ITGA3-215ENST00000515147 RTL9Q8NET4 1388 aa23.45■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 DGKZQ13574 1117 aa23.45■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 WASHC4Q2M389 1173 aa23.45■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.45■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 POLLQ9UGP5 575 aa23.45■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 MBIPQ9NS73 344 aa23.44■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 HYPKQ9NX55 129 aa23.44■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 PSME4Q14997 1843 aa23.44■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 GPSM2P81274 684 aa23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms