RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 POTEAQ6S8J7 498 aa6.77□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 HMX2A2RU54 273 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 J3QW42 95 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 LGR5O75473 907 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 C8AP07357 584 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 IFT43Q96FT9 208 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 SASH3O75995 380 aa6.75□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 WISP1O95388 367 aa6.75□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 WNT11O96014 354 aa6.75□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 NFIAQ12857 509 aa6.75□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 MCM6Q14566 821 aa6.75□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 Q6ZS46 218 aa6.75□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 DTX1Q86Y01 620 aa6.75□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 ABI1Q8IZP0 508 aa6.75□□□□□ -1.33
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SENP6-208ENST00000483859 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 CLDN10P78369 228 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 SETDB1Q15047 1291 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 CCDC102BQ68D86 513 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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SENP6-208ENST00000483859 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.73□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 POM121Q96HA1 1249 aa6.73□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 GSC2O15499 205 aa6.72□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 RARAP10276 462 aa6.72□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 TTC9Q92623 222 aa6.72□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 COL26A1Q96A83 441 aa6.72□□□□□ -1.33
SENP6-208ENST00000483859 USP17L5A8MUK1 530 aa6.71□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 GRIK1P39086 918 aa6.71□□□□□ -1.34
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SENP6-208ENST00000483859 EFCC1Q9HA90 598 aa6.71□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.71□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.71□□□□□ -1.34
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SENP6-208ENST00000483859 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.7□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.7□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.7□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 KLK14Q9P0G3 267 aa6.7□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.69□□□□□ -1.34
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SENP6-208ENST00000483859 RNF43Q68DV7 783 aa6.69□□□□□ -1.34
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SENP6-208ENST00000483859 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 ZMYND15Q9H091 742 aa6.69□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.69□□□□□ -1.34
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SENP6-208ENST00000483859 CDC25BP30305 580 aa6.68□□□□□ -1.34
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SENP6-208ENST00000483859 FLIIQ13045 1269 aa6.68□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 ACAD11Q709F0 780 aa6.68□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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SENP6-208ENST00000483859 LINC01387J3KSC0 135 aa6.67□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.67□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 COL19A1Q14993 1142 aa6.66□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 ZNF124Q15973 351 aa6.66□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 IER5Q5VY09 327 aa6.66□□□□□ -1.34
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SENP6-208ENST00000483859 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.66□□□□□ -1.34
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SENP6-208ENST00000483859 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.66□□□□□ -1.34
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SENP6-208ENST00000483859 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 WDR64B1ANS9 1081 aa6.65□□□□□ -1.34
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SENP6-208ENST00000483859 DKK1O94907 266 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 SOX11P35716 441 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 SIK1P57059 783 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 OGFOD1Q8N543 542 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SENP6-208ENST00000483859 ARID3CA6NKF2 412 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP6-208ENST00000483859 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SENP6-208ENST00000483859 NRLP54845 237 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP6-208ENST00000483859 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SENP6-208ENST00000483859 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP6-208ENST00000483859 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.64□□□□□ -1.35
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