RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470504.1

PTPRZ1-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, human

TSL 4

Gene PTPRZ1, Length 549 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRZ1-204	ENST00000470504	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	MAP2K2	P36507	400 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	CXCL9	Q07325	125 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	TAF1	P21675	1872 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	CA12	O43570	354 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	BBOX1	O75936	387 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	FAM161A	Q3B820	660 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	SP8	Q8IXZ3	490 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	MPND	Q8N594	471 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	AOC2	O75106	756 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	TNIP1	Q15025	636 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	PDIA6	Q15084	440 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	RAD17	O75943	681 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	ANXA1	P04083	346 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	GRAP	Q13588	217 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	PROSER3	Q2NL68	480 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	TMC4	Q7Z404	712 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	NLRP10	Q86W26	655 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	TSKS	Q9UJT2	592 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	COPS6	Q7L5N1	327 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PTPRZ1-204	ENST00000470504	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504		H7C1D1	291 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	SLC34A2	O95436	690 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	RGS19	P49795	217 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	RIPK4	P57078	832 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	NOG	Q13253	232 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	TCIRG1	Q13488	830 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	YDJC	A8MPS7	323 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	MICALL2	Q8IY33	904 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	NECTIN2	Q92692	538 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	DPF2	Q92785	391 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	HUNK	P57058	714 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	WASHC4	Q2M389	1173 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	CFAP44	Q96MT7	982 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	PSME4	Q14997	1843 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	SCN9A	Q15858	1988 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	SHTN1	A0MZ66	631 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	PSMD14	O00487	310 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	DGKZ	Q13574	1117 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	USP48	Q86UV5	1035 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	C6orf229	H3BNL8	230 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	HOXB7	P09629	217 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	RGMB	Q6NW40	437 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRZ1-204	ENST00000470504	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		10.35	□□□□□ -0.75

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