RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468077.5

TARBP1-204, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TARBP1, Length 514 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-204ENST00000468077 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 RAD17O75943 681 aa20.49■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 TNIP1Q15025 636 aa20.49■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 NFE2L2Q16236 605 aa20.49■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 MPNDQ8N594 471 aa20.49■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 BBOX1O75936 387 aa20.48■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 NOGQ13253 232 aa20.48■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.48■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.48■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.48■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.48■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.48■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 DGKZQ13574 1117 aa20.47■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 SP8Q8IXZ3 490 aa20.47■□□□□ 0.87
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TARBP1-204ENST00000468077 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.46■□□□□ 0.87
TARBP1-204ENST00000468077 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.46■□□□□ 0.87
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TARBP1-204ENST00000468077 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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TARBP1-204ENST00000468077 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.45■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.45■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 H7C1D1 291 aa20.44■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 GRAPQ13588 217 aa20.44■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 MICALL2Q8IY33 904 aa20.44■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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TARBP1-204ENST00000468077 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.43■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 SHTN1A0MZ66 631 aa20.42■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 YDJCA8MPS7 323 aa20.42■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 ANXA1P04083 346 aa20.42■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 PDIA6Q15084 440 aa20.42■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 TMC4Q7Z404 712 aa20.42■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 USP48Q86UV5 1035 aa20.42■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 NLRP10Q86W26 655 aa20.42■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.42■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 TAF1P21675 1872 aa20.4■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.4■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 ZIC5Q96T25 663 aa20.4■□□□□ 0.86
TARBP1-204ENST00000468077 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.39■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 DPF2Q92785 391 aa20.39■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 PSMD14O00487 310 aa20.38■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 RGMBQ6NW40 437 aa20.38■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 COPS6Q7L5N1 327 aa20.38■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.38■□□□□ 0.85
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TARBP1-204ENST00000468077 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.38■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.38■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 TCIRG1Q13488 830 aa20.37■□□□□ 0.85
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TARBP1-204ENST00000468077 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.37■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 NECTIN2Q92692 538 aa20.37■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.37■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 DLK2Q6UY11 383 aa20.36■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 CCDC102AQ96A19 550 aa20.36■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 ADM5C9JUS6 153 aa20.35■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.35■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.34■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 C6orf229H3BNL8 230 aa20.34■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.34■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 RIMBP2O15034 1052 aa20.33■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 ECE2O60344 883 aa20.33■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 EGFRP00533 1210 aa20.33■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 SOX10P56693 466 aa20.33■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 RIPK4P57078 832 aa20.33■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 ZNF428Q96B54 188 aa20.33■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 EYA3Q99504 573 aa20.33■□□□□ 0.85
TARBP1-204ENST00000468077 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.32■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 SULF1Q8IWU6 871 aa20.32■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 GGA3Q9NZ52 723 aa20.32■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 RTL9Q8NET4 1388 aa20.32■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 TRPA1O75762 1119 aa20.31■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 RNF186Q9NXI6 227 aa20.31■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 SLC10A3P09131 477 aa20.3■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.3■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 POLLQ9UGP5 575 aa20.3■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 COL4A1P02462 1669 aa20.29■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 SCN9AQ15858 1988 aa20.29■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 GPSM2P81274 684 aa20.29■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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