RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445482.2

VGF-202, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VGF, Length 2,477 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-202ENST00000445482 TSC1Q92574 1164 aa25.53■■□□□ 1.68
VGF-202ENST00000445482 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.53■■□□□ 1.68
VGF-202ENST00000445482 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
VGF-202ENST00000445482 KIF3AQ9Y496 699 aa25.53■■□□□ 1.68
VGF-202ENST00000445482 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.52■■□□□ 1.68
VGF-202ENST00000445482 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.52■■□□□ 1.68
VGF-202ENST00000445482 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.52■■□□□ 1.68
VGF-202ENST00000445482 ZNF710Q8N1W2 664 aa25.52■■□□□ 1.68
VGF-202ENST00000445482 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
VGF-202ENST00000445482 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.52■■□□□ 1.68
VGF-202ENST00000445482 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.52■■□□□ 1.68
VGF-202ENST00000445482 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.52■■□□□ 1.68
VGF-202ENST00000445482 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.52■■□□□ 1.68
VGF-202ENST00000445482 COL18A1P39060 1754 aa25.51■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 A0A0D9SFI3 127 aa25.51■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.51■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 HSPA2P54652 639 aa25.5■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.5■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 NECTIN1Q15223 517 aa25.49■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.49■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 A0A087WZG4 1122 aa25.49■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.49■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.49■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 TPM3P06753 285 aa25.48■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.48■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.48■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 PDE4CQ08493 712 aa25.47■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 TFCP2Q12800 502 aa25.47■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.47■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 GJB2P29033 226 aa25.47■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.46■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.46■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 VPS53Q5VIR6 699 aa25.46■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 NECAB1Q8N987 351 aa25.46■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 KIAA1524Q8TCG1 905 aa25.46■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.45■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 MAP4K1Q92918 833 aa25.45■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.45■■□□□ 1.67
VGF-202ENST00000445482 HIP1O00291 1037 aa25.45■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 CHGBP05060 677 aa25.45■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 MTMR6Q9Y217 621 aa25.45■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 SLC27A2O14975 620 aa25.44■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 AP5Z1O43299 807 aa25.44■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 CCDC192P0DO97 292 aa25.44■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 ME3Q16798 604 aa25.44■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.44■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 COPRSQ9NQ92 184 aa25.44■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 TNNI3KQ59H18 835 aa25.43■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 KCNF1Q9H3M0 494 aa25.43■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.43■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.43■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 FAM177BA6PVY3 158 aa25.43■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.43■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 PYCARDQ9ULZ3 195 aa25.43■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 SPC24Q8NBT2 197 aa25.42■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 NBPF26B4DH59 902 aa25.42■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 NBPF14Q5TI25 921 aa25.42■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.42■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 NBPF15Q8N660 670 aa25.42■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 KCNB2Q92953 911 aa25.42■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.42■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 ST3GAL1Q11201 340 aa25.41■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.41■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.41■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.41■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.41■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.41■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 DCCP43146 1447 aa25.41■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 MRC1P22897 1456 aa25.4■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 A1BGP04217 495 aa25.4■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.4■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 CBX1P83916 185 aa25.39■■□□□ 1.66
VGF-202ENST00000445482 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 BRINP3Q76B58 766 aa25.39■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.38■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.38■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.38■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.37■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
VGF-202ENST00000445482 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms