RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 SPEF2Q9C093 1822 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 CEP85Q6P2H3 762 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 CACNA1SQ13698 1873 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 SRGAP3O43295 1099 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 CSF1RP07333 972 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 PDE6BP35913 854 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 FAM161AQ3B820 660 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 GREM2Q9H772 168 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 ATP8B2P98198 1209 aa25.7■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 MTX1Q13505 466 aa25.7■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 KLHL34Q8N239 644 aa25.7■■□□□ 1.71
HOXA4-202ENST00000428284 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 CRY2Q49AN0 593 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 RTL9Q8NET4 1388 aa25.67■■□□□ 1.7
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HOXA4-202ENST00000428284 HMMRO75330 724 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 ITGA6P23229 1130 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.66■■□□□ 1.7
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HOXA4-202ENST00000428284 H0YIN7 160 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 SSH3Q8TE77 659 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 SRGNP10124 158 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 COL4A1P02462 1669 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXA4-202ENST00000428284 CHRNA5P30532 468 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 POLA2Q14181 598 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 NPR1P16066 1061 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 MASTLQ96GX5 879 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 SYT17Q9BSW7 474 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 TGFB2P61812 414 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
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HOXA4-202ENST00000428284 GRAPQ13588 217 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 A0A0G2JLW4 131 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 DPEP1P16444 411 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 STYK1Q6J9G0 422 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 SIL1Q9H173 461 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 COPRSQ9NQ92 184 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 SLX4Q8IY92 1834 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXA4-202ENST00000428284 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 ALDH1B1P30837 517 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1B0GUL6 1792 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 IGHDP01880 384 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
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HOXA4-202ENST00000428284 CNKSR1Q969H4 720 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 EYA2O00167 538 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 BBOX1O75936 387 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 KCNA3P22001 575 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC24Q50LG9 513 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 DCTPP1Q9H773 170 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 FBXO3Q9UK99 471 aa25.52■■□□□ 1.68
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