RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE4AQ14139 1066 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 ERVK-7P63135 1459 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 GNG11P61952 73 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAAF4Q8WXU2 420 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 PRIMPOLQ96LW4 560 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 UBA7P41226 1012 aa12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 NLRP5P59047 1200 aa12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2HP62256 183 aa12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNH5Q8NCM2 988 aa12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 DYNC1I1O14576 645 aa12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 IARSP41252 1262 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 UVSSAQ2YD98 709 aa12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 CTR9Q6PD62 1173 aa12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAI2Q9GZS0 605 aa12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 USP16Q9Y5T5 823 aa12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 TCERG1LQ5VWI1 586 aa12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC102BQ68D86 513 aa12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 MYD88Q99836 296 aa12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM27P14373 513 aa12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 CTNNA2P26232 953 aa12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 LMAN1P49257 510 aa12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF652Q9Y2D9 606 aa12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 DISP3Q9P2K9 1392 aa12.65□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 FSD2A1L4K1 749 aa12.65□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 GJB2P29033 226 aa12.65□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 NOP2P46087 812 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC40Q4G0X9 1142 aa12.65□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 EVI5LQ96CN4 794 aa12.65□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 PANK2Q9BZ23 570 aa12.65□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa12.65□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 AKR1B10O60218 316 aa12.64□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 AMPD3Q01432 767 aa12.64□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP4R3AQ6IN85 833 aa12.64□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa12.64□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 CATIPQ7Z7H3 387 aa12.64□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 TICAM2Q86XR7 235 aa12.64□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 TMX1Q9H3N1 280 aa12.64□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 KANK3Q6NY19 840 aa12.64□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 N4BP3O15049 544 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC96Q2M329 555 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC150Q8NCX0 1101 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A087WZG4 1122 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 DCAF8L1A6NGE4 600 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 MAATS1Q7Z4T9 603 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKLE2Q86XL3 938 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 CALML4Q96GE6 196 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 JADE2Q9NQC1 790 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 FLIIQ13045 1269 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 AMOTQ4VCS5 1084 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP135Q66GS9 1140 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 EHBP1Q8NDI1 1231 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 SCLT1Q96NL6 688 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D32Q96NH3 1257 aa12.62□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 MICU3Q86XE3 530 aa12.62□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 MYO1BO43795 1136 aa12.62□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC5A1P13866 664 aa12.62□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM114A1Q8IWE2 563 aa12.62□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP112Q8N8E3 955 aa12.62□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 ARFGAP3Q9NP61 516 aa12.62□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 HOMER2Q9NSB8 354 aa12.62□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 SPDYE4A6NLX3 237 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 CUL5Q93034 780 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 NEK1Q96PY6 1258 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT222Q8N1A0 295 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 C3P01024 1663 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPRCP08575 1304 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF5BP33176 963 aa12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 913.2 ms