RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PARP10Q53GL7 1025 aa22.02■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.02■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SP8Q8IXZ3 490 aa22.02■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.02■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF186Q9NXI6 227 aa22.02■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.02■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.01■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCC4O15439 1325 aa22.01■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCTN1Q14203 1278 aa22■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC10A5Q5PT55 438 aa22■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MICALL2Q8IY33 904 aa22■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DPF2Q92785 391 aa22■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYL6BP14649 208 aa21.98■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GCC1Q96CN9 775 aa21.97■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.96■■□□□ 1.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SHTN1A0MZ66 631 aa21.95■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 YDJCA8MPS7 323 aa21.95■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC10A3P09131 477 aa21.95■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.95■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMC4Q7Z404 712 aa21.95■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSRNP1Q96S65 589 aa21.95■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERBB4Q15303 1308 aa21.95■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DLK2Q6UY11 383 aa21.94■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.94■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRAPQ13588 217 aa21.92■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.92■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADM5C9JUS6 153 aa21.91■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMD14O00487 310 aa21.91■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SULF1Q8IWU6 871 aa21.91■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WASHC4Q2M389 1173 aa21.9■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.9■■□□□ 1.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEFMP07197 916 aa21.89■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EGFRP00533 1210 aa21.88■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.88■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.88■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.87■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FKBP1BP68106 108 aa21.86■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.86■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.86■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.86■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.86■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.86■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDCA5Q96FF9 252 aa21.85■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GGA3Q9NZ52 723 aa21.85■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.84■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLRP10Q86W26 655 aa21.84■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EYA3Q99504 573 aa21.84■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ECE2O60344 883 aa21.83■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.83■■□□□ 1.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C6orf229H3BNL8 230 aa21.82■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIMBP2O15034 1052 aa21.82■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAMB2P55268 1798 aa21.82■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.81■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RTL9Q8NET4 1388 aa21.8■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDIA6Q15084 440 aa21.8■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D8O95759 1140 aa21.79■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP2R1AP30153 589 aa21.79■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TCIRG1Q13488 830 aa21.79■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLLQ9UGP5 575 aa21.79■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DOK7Q18PE1 504 aa21.78■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.78■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.78■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR25O00155 361 aa21.77■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COPS6Q7L5N1 327 aa21.77■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NECTIN2Q92692 538 aa21.77■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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