RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 USP48Q86UV5 1035 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 HUNKP57058 714 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 MPNDQ8N594 471 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 PPP2R1AP30153 589 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 TNIP1Q15025 636 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 PARP10Q53GL7 1025 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 SP8Q8IXZ3 490 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 YDJCA8MPS7 323 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXD12-201ENST00000404162 BBOX1O75936 387 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 LAMB2P55268 1798 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 SOX10P56693 466 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 H7C1D1 291 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 MICALL2Q8IY33 904 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 RGMBQ6NW40 437 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 ERBB4Q15303 1308 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 TAF1P21675 1872 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 PDIA6Q15084 440 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD12-201ENST00000404162 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 EGFRP00533 1210 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 ANXA1P04083 346 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 GRAPQ13588 217 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 RNF186Q9NXI6 227 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 ADM5C9JUS6 153 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 PSMD14O00487 310 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 TRPA1O75762 1119 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 PROSER3Q2NL68 480 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 DPF2Q92785 391 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 NLRP10Q86W26 655 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC102AQ96A19 550 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 NEFMP07197 916 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 NFE2L2Q16236 605 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD12-201ENST00000404162 CSRNP1Q96S65 589 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 RIMBP2O15034 1052 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 WASHC4Q2M389 1173 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF428Q96B54 188 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 SLC10A3P09131 477 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 COPS6Q7L5N1 327 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 TCIRG1Q13488 830 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 TMC4Q7Z404 712 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 DOK7Q18PE1 504 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 NECTIN2Q92692 538 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 POLLQ9UGP5 575 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 RTL9Q8NET4 1388 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 C6orf229H3BNL8 230 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
HOXD12-201ENST00000404162 ECE2O60344 883 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD12-201ENST00000404162 GPSM2P81274 684 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD12-201ENST00000404162 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD12-201ENST00000404162 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD12-201ENST00000404162 COL4A1P02462 1669 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD12-201ENST00000404162 CDCA5Q96FF9 252 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD12-201ENST00000404162 GGA3Q9NZ52 723 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD12-201ENST00000404162 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD12-201ENST00000404162 SULF1Q8IWU6 871 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD12-201ENST00000404162 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms