RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.57■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.57■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.57■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 F8W031 263 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 GIMAP7Q8NHV1 300 aa24.57■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 ACEP12821 1306 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 ISM2Q6H9L7 571 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM107BQ9H098 131 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 PANK2Q9BZ23 570 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 CTR9Q6PD62 1173 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 TNRQ92752 1358 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 POLD1P28340 1107 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 CETN1Q12798 172 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 OGFOD1Q8N543 542 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 NECAB1Q8N987 351 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 SYKP43405 635 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 RMND1Q9NWS8 449 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 EHBP1Q8NDI1 1231 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 GRIN2AQ12879 1464 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 BICD1Q96G01 975 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 UBA7P41226 1012 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 PDE1AP54750 535 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 BRF1Q92994 677 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 GNG11P61952 73 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 USP48Q86UV5 1035 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 MEIS3Q99687 375 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 FANCAO15360 1455 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 IDEP14735 1019 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 SNX21Q969T3 373 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD28-201ENST00000399451 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 CTNNA2P26232 953 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.511e-8■■■■□ 23.6
ANKRD28-201ENST00000399451 TCERG1LQ5VWI1 586 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 PPFIA3O75145 1194 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 TSPY3P0CV98 308 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 TSPY8P0CW00 308 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 UBASH3AP57075 661 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 SPECC1Q5M775 1068 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 JADE2Q9NQC1 790 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 NF2P35240 595 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 DDB1Q16531 1140 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.513e-8■□□□□ 9.7
ANKRD28-201ENST00000399451 COMMD10Q9Y6G5 202 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 HOOK3Q86VS8 718 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 PICALMQ13492 652 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 NBPF14Q5TI25 921 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 EXOC1Q9NV70 894 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 NLRP3Q96P20 1036 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 KRT23Q9C075 422 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 N4BP3O15049 544 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 TRIM47Q96LD4 638 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 WTAPQ15007 396 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 STX8Q9UNK0 236 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC175P0C221 793 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 BMP15O95972 392 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 ALG1Q9BT22 464 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD28-201ENST00000399451 F13A1P00488 732 aa24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms