RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384143.1

RNU6-398P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 398, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-398P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-398P-201ENST00000384143 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 PCNTO95613 3336 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 ADH1BP00325 375 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 RFC4P35249 363 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 SPG7Q9UQ90 795 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 ITGB4P16144 1822 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 NFKBIEO00221 500 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 NR1I2O75469 434 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 LMNB1P20700 586 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 CNTNAP1P78357 1384 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 TONSLQ96HA7 1378 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRR20EP86478 221 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRR20CP86479 221 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRR20DP86480 221 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRR20BP86481 221 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRR20AP86496 221 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 PLCB2Q00722 1185 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 PHOX2BQ99453 314 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 TM4SF1P30408 202 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 LBX1P52954 281 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 ABHD8Q96I13 439 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-398P-201ENST00000384143 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 GDF9O60383 454 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 VEGFBP49765 207 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 THAP11Q96EK4 314 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 NFIXQ14938 502 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 MORN1Q5T089 497 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 TTLL6Q8N841 843 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 AIDAQ96BJ3 306 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 PASKQ96RG2 1323 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 SBF1O95248 1867 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 CABP4P57796 275 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 ERFEQ4G0M1 354 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF697Q5TEC3 545 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF787Q6DD87 383 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 NLRP7Q8WX94 980 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 SPSB2Q99619 263 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 DGAT1O75907 488 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 SERPINB2P05120 415 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 POLKQ9UBT6 870 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 TJP1Q07157 1748 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 C21orf2O43822 256 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 GCGRP47871 477 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 RGS19P49795 217 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 FUT2Q10981 343 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 LDHDQ86WU2 507 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 NRXN2Q9P2S2 1712 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 COL15A1P39059 1388 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 RASSF10A6NK89 507 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 H0YIN7 160 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 TNFRSF10AO00220 468 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 PKDCCQ504Y2 493 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.59□□□□□ -1.35
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