RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 CRY2Q49AN0 593 aa29.49■■■□□ 2.31
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
PDSS1-201ENST00000376215 DLEC1Q9Y238 1755 aa29.48■■■□□ 2.31
PDSS1-201ENST00000376215 COL4A1P02462 1669 aa29.47■■■□□ 2.31
PDSS1-201ENST00000376215 PDE6BP35913 854 aa29.47■■■□□ 2.31
PDSS1-201ENST00000376215 LRP5O75197 1615 aa29.46■■■□□ 2.31
PDSS1-201ENST00000376215 CEP85Q6P2H3 762 aa29.46■■■□□ 2.31
PDSS1-201ENST00000376215 GREM2Q9H772 168 aa29.46■■■□□ 2.31
PDSS1-201ENST00000376215 MTX1Q13505 466 aa29.45■■■□□ 2.31
PDSS1-201ENST00000376215 FAM161AQ3B820 660 aa29.45■■■□□ 2.31
PDSS1-201ENST00000376215 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.45■■■□□ 2.31
PDSS1-201ENST00000376215 AAMPQ13685 434 aa29.45■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC152Q4G0S7 254 aa29.45■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa29.44■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 SRGNP10124 158 aa29.44■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.44■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 CHRNA5P30532 468 aa29.43■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 SIRT2Q8IXJ6 389 aa29.43■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 CD2APQ9Y5K6 639 aa29.43■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 RTL9Q8NET4 1388 aa29.43■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 SPEF2Q9C093 1822 aa29.43■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 CACNA1SQ13698 1873 aa29.42■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 ATP8B2P98198 1209 aa29.42■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 C2CD5Q86YS7 1000 aa29.42■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 KLHL34Q8N239 644 aa29.42■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 SEC31BQ9NQW1 1179 aa29.42■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 SRGAP3O43295 1099 aa29.41■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 ITGA6P23229 1130 aa29.4■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 H0YIN7 160 aa29.39■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
PDSS1-201ENST00000376215 A0A0G2JLW4 131 aa29.38■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 DPEP1P16444 411 aa29.38■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 TGFB2P61812 414 aa29.38■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.38■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 NPR1P16066 1061 aa29.38■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 KCNA3P22001 575 aa29.38■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 POLA2Q14181 598 aa29.38■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 SSH3Q8TE77 659 aa29.38■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 MASTLQ96GX5 879 aa29.38■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC57Q2TAC2 916 aa29.37■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 KLHDC4Q8TBB5 520 aa29.37■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.36■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.36■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 STYK1Q6J9G0 422 aa29.35■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 CRAMP1Q96RY5 1269 aa29.35■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 SLX4Q8IY92 1834 aa29.35■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.29
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PDSS1-201ENST00000376215 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 GRAPQ13588 217 aa29.33■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
PDSS1-201ENST00000376215 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 SYT17Q9BSW7 474 aa29.31■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 RPS8P62241 208 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 COPRSQ9NQ92 184 aa29.31■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 HMMRO75330 724 aa29.3■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.3■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 SLC51AQ86UW1 340 aa29.3■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa29.3■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 ALDH1B1P30837 517 aa29.29■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.29■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 A0A1B0GUL6 1792 aa29.28■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 CNKSR1Q969H4 720 aa29.28■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 SIL1Q9H173 461 aa29.28■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 LRRC37AA6NMS7 1700 aa29.28■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 LRRC24Q50LG9 513 aa29.27■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 PIM2Q9P1W9 311 aa29.27■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 WWC3Q9ULE0 1092 aa29.27■■■□□ 2.28
PDSS1-201ENST00000376215 BBOX1O75936 387 aa29.26■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 IGHDP01880 384 aa29.26■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa29.26■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 TTLL6Q8N841 843 aa29.26■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 MPHOSPH8Q99549 860 aa29.26■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 EYA2O00167 538 aa29.24■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 SURF6O75683 361 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.24■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa29.24■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa29.23■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa29.22■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 CIAO1O76071 339 aa29.22■■■□□ 2.27
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