RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 COPS6Q7L5N1 327 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 TPM3P06753 285 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 MAP3K11Q16584 847 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 FERMT3Q86UX7 667 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 PHKG2P15735 406 aa21.64■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 TNNI3KQ59H18 835 aa21.64■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.64■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 MEGF6O75095 1541 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 MPNDQ8N594 471 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 GTF3C6Q969F1 213 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF609O15014 1411 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 LIG1P18858 919 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 PLCB2Q00722 1185 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 SPATA32Q96LK8 384 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 TFCP2Q12800 502 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 NEK1Q96PY6 1258 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 COL18A1P39060 1754 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 AP5Z1O43299 807 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 TYRO3Q06418 890 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 STK3Q13188 491 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 TNMDQ9H2S6 317 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 GLI3P10071 1580 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 HAUS7Q99871 368 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS3-201ENST00000355530 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.58■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 DCAF5Q96JK2 942 aa21.58■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.58■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 DACT1Q9NYF0 836 aa21.58■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.58■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 LAMA4Q16363 1823 aa21.58■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 CAMK4Q16566 473 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 USP16Q9Y5T5 823 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 PALLDQ8WX93 1383 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 JAK2O60674 1132 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 RESTQ13127 1097 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 Q6ZUG5 572 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 BRF1Q92994 677 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 A0A087WZG4 1122 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 CYP21A2P08686 494 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms