RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 RPS6KB1P23443 525 aa18.1■□□□□ 0.49
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PTPRU-201ENST00000345512 CBX8Q9HC52 389 aa18.09■□□□□ 0.49
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PTPRU-201ENST00000345512 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.09■□□□□ 0.49
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PTPRU-201ENST00000345512 CEP152O94986 1710 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 ZSCAN12O43309 604 aa18.04■□□□□ 0.48
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PTPRU-201ENST00000345512 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa18.04■□□□□ 0.48
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PTPRU-201ENST00000345512 TMX1Q9H3N1 280 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
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PTPRU-201ENST00000345512 BEND3Q5T5X7 828 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 IFNL2Q8IZJ0 200 aa18.04■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 NBPF6Q5VWK0 638 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 SIRT1Q96EB6 747 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 NBPF4Q96M43 638 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 NACAP1Q9BZK3 213 aa18.03■□□□□ 0.48
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PTPRU-201ENST00000345512 CCDC150Q8NCX0 1101 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 ACBD3Q9H3P7 528 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 TDO2P48775 406 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 LRMPQ12912 555 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 KRT222Q8N1A0 295 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 MARCH6O60337 910 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 KLHL10Q6JEL2 608 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 MICU3Q86XE3 530 aa18.02■□□□□ 0.48
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