RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 STRN4Q9NRL3 753 aa24.88■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.88■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.88■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 STX6O43752 255 aa24.88■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 TAF5LO75529 589 aa24.88■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNJ4P48050 445 aa24.88■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.88■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 ME3Q16798 604 aa24.87■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.87■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.87■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.87■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.87■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.87■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 ITGB4P16144 1822 aa24.87■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.87■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 RBSNQ9H1K0 784 aa24.87■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.86■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 PSMA5P28066 241 aa24.86■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.86■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.86■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.86■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.86■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF20Q5VTR2 975 aa24.85■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR108Q9NPR9 543 aa24.85■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 F13A1P00488 732 aa24.84■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 GJB2P29033 226 aa24.84■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.84■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 PALLDQ8WX93 1383 aa24.84■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 CHGBP05060 677 aa24.84■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 USP48Q86UV5 1035 aa24.84■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.84■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 SPEF2Q9C093 1822 aa24.83■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 SYCE3A1L190 88 aa24.83■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 RPS6KB1P23443 525 aa24.83■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
KCNQ1-202ENST00000335475 MTMR6Q9Y217 621 aa24.83■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.82■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.82■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 DISP2A7MBM2 1401 aa24.81■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 EVA1CP58658 441 aa24.81■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.81■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 LAMA4Q16363 1823 aa24.81■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.81■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.81■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 NECAB1Q8N987 351 aa24.81■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.81■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.81■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 ATG3Q9NT62 314 aa24.8■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 EYA2O00167 538 aa24.8■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRC24Q50LG9 513 aa24.8■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.8■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 DTNBO60941 627 aa24.79■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 CIAO1O76071 339 aa24.79■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 CLCN1P35523 988 aa24.79■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 LRP6O75581 1613 aa24.79■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 TCIRG1Q13488 830 aa24.78■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.78■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD1Q15327 319 aa24.78■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.78■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.77■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 ESPNB1AK53 854 aa24.77■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.77■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 PIGBQ92521 554 aa24.77■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.77■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.77■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.77■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
KCNQ1-202ENST00000335475 TIMM10P62072 90 aa24.76■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 KRT32Q14532 448 aa24.76■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.76■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.76■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.76■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 TICAM2Q86XR7 235 aa24.75■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.75■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 GOLIM4O00461 696 aa24.74■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 CYP21A2P08686 494 aa24.74■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1B0GUL7 405 aa24.73■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.73■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 BTG4Q9NY30 223 aa24.73■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 UBE2HP62256 183 aa24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 906.4 ms