RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

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Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.5■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 TIMM10P62072 90 aa27.5■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa27.5■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa27.49■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa27.49■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 PHLPP1O60346 1717 aa27.49■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.49■■□□□ 1.99
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SNX18-201ENST00000326277 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.48■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 RFX7Q2KHR2 1363 aa27.48■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 BRD1O95696 1058 aa27.48■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.48■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.48■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 JCADQ9P266 1359 aa27.47■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 SLC27A2O14975 620 aa27.47■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 ZNF609O15014 1411 aa27.47■■□□□ 1.99
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SNX18-201ENST00000326277 NRAPQ86VF7 1730 aa27.47■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.47■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 VPS53Q5VIR6 699 aa27.47■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 PDRG1Q9NUG6 133 aa27.47■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa27.47■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 GPTP24298 496 aa27.46■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 TAF5LO75529 589 aa27.45■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 CHGBP05060 677 aa27.45■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 LMBRD1Q9NUN5 540 aa27.45■■□□□ 1.99
SNX18-201ENST00000326277 DDB1Q16531 1140 aa27.45■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 KLHL40Q2TBA0 621 aa27.45■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 NLRP10Q86W26 655 aa27.45■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 A0A1B0GUL7 405 aa27.44■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 CSF1RP07333 972 aa27.44■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 SYNE4Q8N205 404 aa27.44■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 KBTBD3Q8NAB2 608 aa27.44■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 CHAMP1Q96JM3 812 aa27.44■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27.44■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 RNF20Q5VTR2 975 aa27.43■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 CEP126Q9P2H0 1117 aa27.43■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.42■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 LARGE1O95461 756 aa27.42■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
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SNX18-201ENST00000326277 FBXO3Q9UK99 471 aa27.42■■□□□ 1.98
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SNX18-201ENST00000326277 PALLDQ8WX93 1383 aa27.41■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 PSMA5P28066 241 aa27.4■■□□□ 1.98
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SNX18-201ENST00000326277 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa27.4■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP27.4■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa27.4■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.4■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.39■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 HMG20BQ9P0W2 317 aa27.39■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.39■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
SNX18-201ENST00000326277 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
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SNX18-201ENST00000326277 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.38■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.38■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 A0A0G2JS52 829 aa27.38■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.38■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 TSGA10IPQ3SY00 556 aa27.38■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.38■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 TTLL11Q8NHH1 800 aa27.37■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 NUP98P52948 1817 aa27.37■■□□□ 1.97
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SNX18-201ENST00000326277 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 AKAP2Q9Y2D5 859 aa27.37■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa27.36■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 PIP4K2BP78356 416 aa27.36■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 CCDC83Q8IWF9 413 aa27.36■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 GREM2Q9H772 168 aa27.36■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 ADORA1P30542 326 aa27.35■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 CTSWP56202 376 aa27.35■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 ME3Q16798 604 aa27.35■■□□□ 1.97
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