RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 PARP10Q53GL7 1025 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 TMC4Q7Z404 712 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 SNED1Q8TER0 1413 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNQ3O43525 872 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 HLFQ16534 295 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 LHX8Q68G74 356 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 MPNDQ8N594 471 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCC12Q96J65 1359 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPA1O75762 1119 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKAR2BP31323 418 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA2012Q0VF49 1180 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT26Q7Z3Y9 468 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 USP48Q86UV5 1035 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 SP8Q8IXZ3 490 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 NGEFQ8N5V2 710 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 DPF2Q92785 391 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF26B4DH59 902 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 GPTP24298 496 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS12P25398 132 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 SULF1Q8IWU6 871 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 MICALL2Q8IY33 904 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF186Q9NXI6 227 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 ERBB4Q15303 1308 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD17O75943 681 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 AKAP11Q9UKA4 1901 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 FKBP1BP68106 108 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 SUSD4Q5VX71 490 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 MCM10Q7L590 875 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPM4Q8TD43 1214 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 EYA3Q99504 573 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 HPS5Q9UPZ3 1129 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 COL4A5P29400 1685 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMB4A4D0S4 1761 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 G3V3G9 751 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 NTSR2O95665 410 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC10A3P09131 477 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 MYL6BP14649 208 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC10A5Q5PT55 438 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF34Q8IZ26 560 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 PHACTR3Q96KR7 559 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP98P52948 1817 aa10.4□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCC4O15439 1325 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 GRAPQ13588 217 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 WASHC4Q2M389 1173 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 CSRNP1Q96S65 589 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 UBN2Q6ZU65 1347 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 NECTIN2Q92692 538 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 ZIC5Q96T25 663 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 NF2P35240 595 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 SREBF2Q12772 1141 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 TTLL7Q6ZT98 887 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 SAMD7Q7Z3H4 446 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3TC1Q8TE82 1336 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 ADM5C9JUS6 153 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 C6orf229H3BNL8 230 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMD14O00487 310 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 GABBR2O75899 941 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf67A6NJJ6 358 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDH1A1P00352 501 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 TCIRG1Q13488 830 aa10.35□□□□□ -0.75
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