RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 PDE8AO60658 829 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 KLHL34Q8N239 644 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.17■■□□□ 1.14
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CCDC78-201ENST00000293889 NPHP1O15259 732 aa22.17■■□□□ 1.14
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CCDC78-201ENST00000293889 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.14■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.14■■□□□ 1.14
CCDC78-201ENST00000293889 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.13■■□□□ 1.13
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CCDC78-201ENST00000293889 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.13■■□□□ 1.13
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CCDC78-201ENST00000293889 ST5P78524 1137 aa22.13■■□□□ 1.13
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CCDC78-201ENST00000293889 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.09■■□□□ 1.13
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CCDC78-201ENST00000293889 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.08■■□□□ 1.13
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CCDC78-201ENST00000293889 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.08■■□□□ 1.13
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CCDC78-201ENST00000293889 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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CCDC78-201ENST00000293889 PDE6BP35913 854 aa22.02■■□□□ 1.12
CCDC78-201ENST00000293889 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.02■■□□□ 1.12
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CCDC78-201ENST00000293889 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.02■■□□□ 1.11
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CCDC78-201ENST00000293889 H0YIN7 160 aa21.99■■□□□ 1.11
CCDC78-201ENST00000293889 EYA2O00167 538 aa21.99■■□□□ 1.11
CCDC78-201ENST00000293889 RAB11FIP3O75154 756 aa21.99■■□□□ 1.11
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CCDC78-201ENST00000293889 LRRC24Q50LG9 513 aa21.99■■□□□ 1.11
CCDC78-201ENST00000293889 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.99■■□□□ 1.11
CCDC78-201ENST00000293889 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CCDC78-201ENST00000293889 TAF1P21675 1872 aa21.99■■□□□ 1.11
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CCDC78-201ENST00000293889 NUCB1Q02818 461 aa21.98■■□□□ 1.11
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CCDC78-201ENST00000293889 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.98■■□□□ 1.11
CCDC78-201ENST00000293889 SLX4Q8IY92 1834 aa21.97■■□□□ 1.11
CCDC78-201ENST00000293889 SASH1O94885 1247 aa21.97■■□□□ 1.11
CCDC78-201ENST00000293889 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCDC78-201ENST00000293889 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.97■■□□□ 1.11
CCDC78-201ENST00000293889 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCDC78-201ENST00000293889 FBXO3Q9UK99 471 aa21.97■■□□□ 1.11
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