RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293349.10

PLEKHH3-201, Transcript of pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene PLEKHH3, Length 2,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHH3-201ENST00000293349 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24.06■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 PDIA6Q15084 440 aa24.05■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 CHRNA2Q15822 529 aa24.05■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.05■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.04■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZNF790Q6PG37 636 aa24.04■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 DRC7Q8IY82 874 aa24.04■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 BICD2Q8TD16 824 aa24.04■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 CHST3Q7LGC8 479 aa24.04■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 SPATA32Q96LK8 384 aa24.04■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.04■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.03■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.03■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.03■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.03■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.03■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.03■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 GUCY1B3Q02153 619 aa24.03■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 A0A0G2JLW4 131 aa24.02■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 RPS6KB1P23443 525 aa24.02■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 GCKRQ14397 625 aa24.02■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.02■■□□□ 1.44
PLEKHH3-201ENST00000293349 CCDC192P0DO97 292 aa24.01■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 PSMA5P28066 241 aa24.01■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 RNF20Q5VTR2 975 aa24.01■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 TNMDQ9H2S6 317 aa24.01■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 PTGS1P23219 599 aa24.01■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 FUCA2Q9BTY2 467 aa24.01■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 KCNF1Q9H3M0 494 aa24.01■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 ANO6Q4KMQ2 910 aa24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 PIBF1Q8WXW3 757 aa24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 BRF1Q92994 677 aa24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 LRMPQ12912 555 aa24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 MAP3K11Q16584 847 aa24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 NRBP1Q9UHY1 535 aa24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 SLIT1O75093 1534 aa24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 H3BQV1 296 aa24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 NR1I2O75469 434 aa24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 TYRO3Q06418 890 aa24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 IFFO2Q5TF58 517 aa24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 Q6ZUG5 572 aa24■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 TAF5LO75529 589 aa23.99■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 UVSSAQ2YD98 709 aa23.99■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 A0A087WZG4 1122 aa23.99■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.99■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.99■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 COL15A1P39059 1388 aa23.98■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.98■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.97■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.97■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 TIMM10P62072 90 aa23.97■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.97■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.97■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 GOLIM4O00461 696 aa23.96■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 KIF20AO95235 890 aa23.96■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 TNNI3KQ59H18 835 aa23.96■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 TRIM5Q9C035 493 aa23.96■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.96■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 NFAT5O94916 1531 aa23.95■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.95■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 NEK1Q96PY6 1258 aa23.95■■□□□ 1.43
PLEKHH3-201ENST00000293349 CYP21A2P08686 494 aa23.95■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 HIP1O00291 1037 aa23.94■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.94■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.94■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 PGBD1Q96JS3 809 aa23.94■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 CBX8Q9HC52 389 aa23.94■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 APOBRQ0VD83 1088 aa23.94■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.94■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.93■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 PDCP20941 246 aa23.93■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 KIF3AQ9Y496 699 aa23.93■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.92■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 SNRKQ9NRH2 765 aa23.92■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 KCNB2Q92953 911 aa23.92■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.91■■□□□ 1.42
PLEKHH3-201ENST00000293349 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms