RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 MRC1P22897 1456 aa29.94■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 TNMDQ9H2S6 317 aa29.94■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 TAF6LQ9Y6J9 622 aa29.94■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 FAM177BA6PVY3 158 aa29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 LUZP1Q86V48 1076 aa29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 SPATA32Q96LK8 384 aa29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 DACT1Q9NYF0 836 aa29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 NEURL1BA8MQ27 555 aa29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF790Q6PG37 636 aa29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 CKAP2LQ8IYA6 745 aa29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 KLHDC4Q8TBB5 520 aa29.92■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 NEXNQ0ZGT2 675 aa29.92■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 STK3Q13188 491 aa29.91■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 SLC39A6Q13433 755 aa29.91■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 JCADQ9P266 1359 aa29.91■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 PTGS1P23219 599 aa29.91■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 GCKRQ14397 625 aa29.91■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 ERBB3P21860 1342 aa29.9■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 ANO6Q4KMQ2 910 aa29.9■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 BCL2L12Q9HB09 334 aa29.9■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 CBX8Q9HC52 389 aa29.9■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.9■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 C5P01031 1676 aa29.9■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 MYL6BP14649 208 aa29.89■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 EPHA10Q5JZY3 1008 aa29.89■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.89■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 SLC52A2Q9HAB3 445 aa29.89■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 HMG20BQ9P0W2 317 aa29.89■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 TSGA10IPQ3SY00 556 aa29.87■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 MYD88Q99836 296 aa29.87■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 CLSTN2Q9H4D0 955 aa29.87■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 PRDM4Q9UKN5 801 aa29.87■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 COPS6Q7L5N1 327 aa29.86■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.86■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 TAF5LO75529 589 aa29.85■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC186Q7Z3E2 898 aa29.85■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.85■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 RGPD5Q99666 1765 aa29.85■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 DRC7Q8IY82 874 aa29.84■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 COPRSQ9NQ92 184 aa29.84■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 NR1I2O75469 434 aa29.83■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 PGBD1Q96JS3 809 aa29.83■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 SCN11AQ9UI33 1791 aa29.83■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 BICD2Q8TD16 824 aa29.83■■■□□ 2.37
CTBP1-201ENST00000290921 JAK2O60674 1132 aa29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 USPL1Q5W0Q7 1092 aa29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 TRIM5Q9C035 493 aa29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 PRDM10Q9NQV6 1147 aa29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 PHKG2P15735 406 aa29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 ATP5JP18859 108 aa29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF75DP51815 510 aa29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 KRT32Q14532 448 aa29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 PLA2G4DQ86XP0 818 aa29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 GTF3C6Q969F1 213 aa29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 NRBP1Q9UHY1 535 aa29.81■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa29.8■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.8■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 LRMPQ12912 555 aa29.8■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 RESTQ13127 1097 aa29.8■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 TNNI3KQ59H18 835 aa29.8■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 NEK1Q96PY6 1258 aa29.8■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa29.8■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 COL15A1P39059 1388 aa29.79■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 BRF1Q92994 677 aa29.79■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.79■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 MST1RQ04912 1400 aa29.79■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF165P49910 485 aa29.79■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 DNAJC25Q9H1X3 360 aa29.79■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 TFCP2Q12800 502 aa29.78■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 PDCL2Q8N4E4 241 aa29.78■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 RFX7Q2KHR2 1363 aa29.77■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 CTIFO43310 598 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CTBP1-201ENST00000290921 Q6ZUG5 572 aa29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms