RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038196.6

Mks1-201, Transcript of Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Mks1, Length 2,499 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1-201ENSMUST00000038196 Tsr2Q8C8T8 191 aa16.12■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Ginm1Q91WR6 327 aa16.12■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Nphp3Q7TNH6 1325 aa16.12■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Gm9992B2RWK3 458 aa16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 ZyxQ62523 564 aa16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Unc93aQ710D3 458 aa16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Bsdc1Q80Y55 427 aa16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Mb21d2Q8C525 428 aa16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Cops6O88545 324 aa16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Gpr182P43142 395 aa16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Gsdma2Q32M21 443 aa16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Kank4Q6P9J5 1016 aa16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Asap2Q7SIG6 958 aa16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Atf7Q8R0S1 413 aa16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 IncenpQ9WU62 880 aa16.11■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Tom1O88746 492 aa16.1■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Ercc3P49135 783 aa16.1■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Nek11Q8C0Q4 628 aa16.1■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Lrrfip2Q91WK0 415 aa16.1■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Ccne2Q9Z238 404 aa16.1■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 SlkO54988 1233 aa16.1■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Ftl2P49945 183 aa16.1■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Babam1Q3UI43 333 aa16.1■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Usp48Q3V0C5 1052 aa16.1■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Krt25Q8VCW2 446 aa16.1■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Ssc5dQ8BV57 1371 aa16.1■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Zkscan8Q8BSL0 588 aa16.09■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Pde4dQ01063 747 aa16.09■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Rnf20Q5DTM8 973 aa16.09■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Mast2Q60592 1734 aa16.08■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Prr5lA2AVJ5 370 aa16.08■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Prl7a2O54831 253 aa16.08■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Cers3Q1A3B0 383 aa16.08■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 EappQ5BU09 281 aa16.08■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Cyp7a1Q64505 503 aa16.08■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Rassf8Q8CJ96 419 aa16.08■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Cchcr1Q8K2I2 770 aa16.08■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Bmp2kQ91Z96 1138 aa16.08■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 Ciao1Q99KN2 339 aa16.08■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Mks1-201ENSMUST00000038196 DpydQ8CHR6 1025 aa16.08■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Sytl4Q9R0Q1 673 aa16.08■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 MetP16056 1379 aa16.07■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa16.07■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa16.07■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Stx6Q9JKK1 255 aa16.07■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Sh3bp5Q9Z131 463 aa16.07■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 TnksQ6PFX9 1320 aa16.07■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 ImpactO55091 318 aa16.07■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa16.06■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 RubcnlQ3TD16 648 aa16.06■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Tmem266Q8BZB3 538 aa16.06■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Pm20d1Q8C165 503 aa16.06■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 SnrkQ8VDU5 748 aa16.06■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Dctn1O08788 1281 aa16.06■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Zbtb38Q3LR78 1197 aa16.06■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Erc1Q99MI1 1120 aa16.06■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Bicdl1A0JNT9 577 aa16.05■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Naa30Q8CES0 364 aa16.05■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Kcnq3Q8K3F6 873 aa16.05■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Irgm2A0A140LIF8 407 aa16.05■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Bin2D3Z6Q9 489 aa16.05■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 TsksO54887 585 aa16.05■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Slf2Q6P9P0 1278 aa16.05■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Ric1Q69ZJ7 1422 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 1700006A11RikB9EHI3 544 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Ctdnep1Q3TP92 244 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Esco1Q69Z69 843 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Susd4Q8BH32 490 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Klc3Q91W40 508 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Foxo4Q9WVH3 505 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Syce3B5KM66 88 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Ppfia3P60469 1194 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 VeztQ3ZK22 780 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Itga6Q61739 1091 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Usp44Q8C2S0 711 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Rdm1Q9CQK3 281 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Hmg20bQ9Z104 317 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Trip6Q9Z1Y4 480 aa16.04■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Atp2b3Q0VF55 1220 aa16.03■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa16.02■□□□□ 0.16
Mks1-201ENSMUST00000038196 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.7 ms