RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	DERL3	Q96Q80	235 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	MIOX	Q9UGB7	285 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TMEM82	A0PJX8	343 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PSMA3	P25788	255 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ADH6	P28332	368 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	HTR1F	P30939	366 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SGSH	P51688	502 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	WNT3	P56703	355 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CXADR	P78310	365 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NTM	Q9P121	344 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	MEMO1	Q9Y316	297 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SOCS5	O75159	536 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NMB	P08949	121 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CSF1	P09603	554 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CHST9	Q7L1S5	443 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	GPR174	Q9BXC1	333 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624		A0A1B0GUH1	482 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	GRM6	O15303	877 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	MED6	O75586	246 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	IFNA4	P05014	189 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NQO2	P16083	231 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NME2	P22392	152 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CCKBR	P32239	447 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CSRP3	P50461	194 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	OR7A5	Q15622	319 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PHB2	Q99623	299 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	MYNN	Q9NPC7	610 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZNF208	O43345	1280 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	LAG3	P18627	525 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SPINT3	P49223	89 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TAS2R38	P59533	333 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PFN3	P60673	137 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	RPE65	Q16518	533 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PARG	Q86W56	976 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	STPG2	Q8N412	459 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZNF480	Q8WV37	535 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	DPH7	Q9BTV6	452 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CHST8	Q9H2A9	424 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	INSL6	Q9Y581	213 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TET1	Q8NFU7	2136 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	TVP23A	A6NH52	213 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624		H0YIV9	168 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CNR1	P21554	472 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	LTB	Q06643	244 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	CRMP1	Q14194	572 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	NFATC4	Q14934	902 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	OR2L5	Q8NG80	312 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	GHITM	Q9H3K2	345 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PXN-222	ENST00000637624	GABARAP	H6UMI1	98 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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