RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619804.1

CPS1-212, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CPS1, Length 1,542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-212ENST00000619804 EPPINO95925 133 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 HMGN1P05114 100 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CELA2AP08217 269 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 IFI30P13284 250 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 ZNF17P17021 662 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 PRKACGP22612 351 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 FPR3P25089 353 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 DPP4P27487 766 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 ELK4P28324 431 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 TACR3P29371 465 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 SRD5A2P31213 254 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CAPGP40121 348 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CD96P40200 585 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 LIMS1P48059 325 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 SMSP52788 366 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 AQP4P55087 323 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CTBP2P56545 445 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 PRKCDQ05655 676 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 Q0VFX4 171 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 NPRL3Q12980 569 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 SELENBP1Q13228 472 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 TUBA3CQ13748 450 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 KEAP1Q14145 624 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CD226Q15762 336 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 TMEM44Q2T9K0 475 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 C3orf33Q6P1S2 294 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 FAHD1Q6P587 224 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 BORAQ6PGQ7 559 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CBLN3Q6UW01 205 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 OAFQ86UD1 273 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CD163Q86VB7 1156 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 SLC22A16Q86VW1 577 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 P3H2Q8IVL5 708 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 NRMQ8IXM6 262 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CLDN22Q8N7P3 220 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 OR4D11Q8NGI4 311 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 OR4C15Q8NGM1 316 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 OR6S1Q8NH40 331 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 RNF138Q8WVD3 245 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 NRG4Q8WWG1 115 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 PSMF1Q92530 271 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 C3orf49Q96BT1 292 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 BPIFA2Q96DR5 249 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 SGTBQ96EQ0 304 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 ASPNQ9BXN1 380 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 TIGARQ9NQ88 270 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 NANSQ9NR45 359 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 FAIMQ9NVQ4 179 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 MED11Q9P086 117 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CHRNA9Q9UGM1 479 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 ZNF337Q9Y3M9 751 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 GMPPBQ9Y5P6 360 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 AP4B1Q9Y6B7 739 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 MED13Q9UHV7 2174 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 C7orf72A4D263 438 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 UNC119BA6NIH7 251 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 SLC16A6O15403 523 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 SEC14L5O43304 696 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 TRAPPC6AO75865 159 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 WDPCPO95876 746 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 GASTP01350 101 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 IFNGP01579 166 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 SP1P08047 785 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CCL3P10147 92 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 TFPIP10646 304 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 PRG2P13727 222 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 POU2F1P14859 743 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 PRKCAP17252 672 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 HK1P19367 917 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 CBLP22681 906 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 GDF1P27539 372 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 POU1F1P28069 291 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 HTR2AP28223 471 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 DAPP51397 102 aa5.69□□□□□ -1.5
CPS1-212ENST00000619804 IST1P53990 364 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms