RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613995.4

PDE4DIP-240, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, human

TSL 5

Gene PDE4DIP, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HHATL	Q9HCP6	504 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	POLE3	Q9NRF9	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CALML5	Q9NZT1	146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ARMCX1	Q9P291	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995		Q9UFV3	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ACAN	P16112	2415 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MTOR	P42345	2549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SLC22A20	A6NK97	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	C19orf84	I3L1E1	186 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FBP2	O00757	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	AP3D1	O14617	1153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DVL2	O14641	736 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TNFSF11	O14788	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	KRT34	O76011	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TOX	O94900	526 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TGM6	O95932	706 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GUSB	P08236	651 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TFPT	P0C1Z6	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GKN3P	P0CG01	181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	IL7R	P16871	459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZNF17	P17021	662 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PGC	P20142	388 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CCNA2	P20248	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	IL11	P20809	199 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	AGA	P20933	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	BMP5	P22003	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SHC1	P29353	583 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	AQP1	P29972	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LSP1	P33241	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PGM1	P36871	562 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MAGEA8	P43361	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZNF136	P52737	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CRISP3	P54108	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CLDN15	P56746	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SESN3	P58005	492 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MTPN	P58546	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GNGT1	P63211	74 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	KCNJ10	P78508	379 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MERTK	Q12866	999 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FOXF2	Q12947	444 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FADD	Q13158	208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SELPLG	Q14242	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GNA13	Q14344	377 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	QPRT	Q15274	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MAPK11	Q15759	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HSPB2	Q16082	182 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CYP51A1	Q16850	503 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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