RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 HAUS8Q9BT25 410 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 TBCDQ9BTW9 1192 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ITPAQ9BY32 194 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 SRXN1Q9BYN0 137 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 DYNLRB1Q9NP97 96 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 CHRAC1Q9NRG0 131 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ASIC5Q9NY37 505 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 FLRT3Q9NZU0 649 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 FOXJ3Q9UPW0 622 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 VDAC3Q9Y277 283 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 AUP1Q9Y679 476 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 AP4B1Q9Y6B7 739 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 KMT2AQ03164 3969 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 BTNL10A8MVZ5 291 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF487B1APH4 448 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 RGS14O43566 566 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 GUCA1CO95843 209 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 IGHV2-5P01817 119 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 MPC1LP0DKB6 136 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 NAGAP17050 411 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 SLC7A1P30825 629 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 GALNSP34059 522 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 SFTPDP35247 375 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 THBS4P35443 961 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 CDKN2BP42772 138 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 SLC1A3P43003 542 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 MTNR1AP48039 350 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ATP4BP51164 291 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ACVR1Q04771 509 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 RAB32Q13637 225 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 RCN2Q14257 317 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 SLMAPQ14BN4 828 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 EFNB3Q15768 340 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 GABRA6Q16445 453 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 CASC4Q6P4E1 433 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 RAD9BQ6WBX8 426 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 LRRC6Q86X45 466 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 KRT73Q86Y46 540 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ACOT4Q8N9L9 421 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 TRIM58Q8NG06 486 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 RNF128Q8TEB7 428 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 CKAP2Q8WWK9 683 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 LPGAT1Q92604 370 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 TMCO6Q96DC7 493 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 KLHDC3Q9BQ90 382 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 AIF1LQ9BQI0 150 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 HEMGNQ9BXL5 484 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 CXorf21Q9HAI6 301 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 LYRM4Q9HD34 91 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 GRID1Q9ULK0 1009 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3.73□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 HACD1B0YJ81 288 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 SOCS2O14508 198 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ADAMDEC1O15204 470 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 GPR137BO60478 399 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 KERAO60938 352 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 RP2O75695 350 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 GPR75O95800 540 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ALOX5P09917 674 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 MYZAPP0CAP1 466 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 S1PR1P21453 382 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ACHEP22303 614 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 NMBRP28336 390 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 CALCRP30988 508 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 PRKAR1BP31321 381 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 PGGT1BP53609 377 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM33P57088 247 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 CARD18P57730 90 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 RAB10P61026 200 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 UBXN1Q04323 297 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 KLHL30Q0D2K2 578 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF154Q13106 437 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ADPRMQ3LIE5 342 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 C4orf46Q504U0 113 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ODF2Q5BJF6 829 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ZDHHC24Q6UX98 284 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 Q6ZTK2 550 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD3-210ENST00000561408 FCRLAQ7L513 359 aa3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms