RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	CD163	Q86VB7	1156 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	COMTD1	Q86VU5	262 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OSTF1	Q92882	214 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	STMN2	Q93045	179 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	WNT2B	Q93097	391 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CHID1	Q9BWS9	393 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	REEP1	Q9H902	201 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	GP6	Q9HCN6	339 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	LRBA	P50851	2863 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM72	A0PK05	275 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TPST2	O60704	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	AGFG2	O95081	481 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CCNA2	P20248	432 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ENPP1	P22413	925 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	RRM2	P31350	389 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CA7	P43166	264 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	STAR	P49675	285 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CLDN15	P56746	228 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	VLDLR	P98155	873 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SPIB	Q01892	262 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	DCST1	Q5T197	706 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OR2T29	Q8NH02	315 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OR10D3	Q8NH80	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM239	Q8WW34	195 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ASPN	Q9BXN1	380 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ERICH4	A6NGS2	130 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SLC22A20	A6NK97	555 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TNFSF11	O14788	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	VAMP5	O95183	116 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CST1	P01037	141 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	IL2RA	P01589	272 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	MT-ND1	P03886	318 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CRH	P06850	196 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TIMP3	P35625	211 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	DIO1	P49895	249 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OR2B6	P58173	313 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	HSF1	Q00613	529 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	MYBPH	Q13203	477 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	FGD3	Q5JSP0	725 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	GGN	Q86UU5	652 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SCAI	Q8N9R8	606 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	PIGX	Q8TBF5	258 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	BDH2	Q9BUT1	245 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730		A0A0J9YW62	118 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CLCA1	A8K7I4	914 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	NPIPB7	O75200	414 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	FKBP6	O75344	327 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	OR6A2	O95222	327 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	FAS	P25445	335 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	SMS	P52788	366 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	HMGA2	P52926	109 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	CLDN20	P56880	219 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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