RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ACOT8O14734 319 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SFTPBP07988 381 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PPIBP23284 216 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SOX3P41225 446 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PCLAFQ15004 111 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MICBQ29980 383 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GLCCI1Q86VQ1 547 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ARRDC1Q8N5I2 433 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR10AD1Q8NGE0 317 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM40Q8WWA1 233 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SORCS1Q8WY21 1168 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM74Q96NL1 305 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ABHD1Q96SE0 405 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GPER1Q99527 375 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TEAD3Q99594 435 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CWH43Q9H720 699 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 COPRSQ9NQ92 184 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OXSMQ9NWU1 459 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MYH7P12883 1935 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 H0Y980 276 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 J3KR12 359 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CHRM4P08173 479 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 C1SP09871 688 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HOXA5P20719 270 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HOXA6P31267 233 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CSNK1A1P48729 337 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 RAB9AP51151 201 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 RHOAP61586 193 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A3Q01959 620 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 DUSP8Q13202 625 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLC14A1Q13336 389 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 EXT1Q16394 746 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 FAM69BQ5VUD6 431 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC6AQ6EIG7 209 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM144Q7Z5S9 345 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF573Q86YE8 665 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GPX8Q8TED1 209 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HGDQ93099 445 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CD180Q99467 661 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CSTL1Q9H114 145 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 RCE1Q9Y256 329 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KCNK6Q9Y257 313 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TNRQ92752 1358 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 AHRRA9YTQ3 701 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MCRIP1C9JLW8 97 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 M0QYT0 321 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 BCL2L11O43521 198 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GLCEO94923 617 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PEX11BO96011 259 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LTFP02788 710 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HIST1H2ABP04908 130 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MELTFP08582 738 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TGFBR1P36897 503 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 DCTP40126 519 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 FASLGP48023 281 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NPBWR1P48145 328 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SOX2P48431 317 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SULT1A1P50225 295 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TNFSF10P50591 281 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CLCN3P51790 818 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TCL1AP56279 114 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SERTAD2Q14140 314 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ALG10Q5BKT4 473 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR52B6Q8NGF0 335 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR13C5Q8NGS8 318 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HIST1H2ACQ93077 130 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HIST1H2BAQ96A08 127 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KLRG1Q96E93 195 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CMTM7Q96FZ5 175 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM19Q96HH6 336 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TRIB1Q96RU8 372 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PEBP4Q96S96 227 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TSSK6Q9BXA6 273 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 WDCPQ9H6R7 721 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NAGKQ9UJ70 344 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HECW1Q76N89 1606 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GRIN2BQ13224 1484 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 A0A087WZ62 844 aa5.21□□□□□ -1.57
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