RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422939.1

TRPS1-204, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-204ENST00000422939 RPL4P36578 427 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 HPCAL1P37235 193 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 MAGEA8P43361 318 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 CCT3P49368 545 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 RPS6P62753 249 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 GBE1Q04446 702 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 PPP1R7Q15435 360 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 TPSAB1Q15661 275 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 CYS1Q717R9 158 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 PAQR7Q86WK9 346 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 IFNEQ86WN2 208 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 MTURNQ8N3F0 131 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 DHRSXQ8N5I4 330 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 FAM3CQ92520 227 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 C12orf66Q96MD2 445 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 COPS8Q99627 209 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 TM2D1Q9BX74 207 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 YY1AP1Q9H869 796 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 MCCC2Q9HCC0 563 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 SLC2A8Q9NY64 477 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 NWD1Q149M9 1564 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 PKD1L2Q7Z442 2459 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-204ENST00000422939 ESYT2A0FGR8 921 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 SNTNA6NMZ2 147 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 JCHAINP01591 159 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 POU2F1P14859 743 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 SDC1P18827 310 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 IMPDH1P20839 514 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 BST1Q10588 318 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 CTSL3PQ5NE16 218 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 BEND3Q5T5X7 828 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 CARD17Q5XLA6 110 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 OR4F3Q6IEY1 312 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 ACSM5Q6NUN0 579 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.4□□□□□ -1.87
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TRPS1-204ENST00000422939 TMEM121Q9BTD3 319 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.4□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 POLE4Q9NR33 117 aa3.4□□□□□ -1.87
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TRPS1-204ENST00000422939 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 TSPAN12O95859 305 aa3.39□□□□□ -1.87
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TRPS1-204ENST00000422939 SCFD1Q8WVM8 642 aa3.39□□□□□ -1.87
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TRPS1-204ENST00000422939 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 CUL7Q14999 1698 aa3.39□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa3.39□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 KDM5BQ9UGL1 1544 aa3.39□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 WDR90Q96KV7 1748 aa3.39□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 NINLQ9Y2I6 1382 aa3.38□□□□□ -1.87
TRPS1-204ENST00000422939 A0A0C4DFX4 3053 aa3.38□□□□□ -1.87
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