RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD28O15084 1053 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 C6orf47O95873 294 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV1-44P01699 117 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 ADRA2AP08913 450 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 GCAP28676 217 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 ELFN2Q5R3F8 820 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 LIPMQ5VYY2 423 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 SHISA2Q6UWI4 295 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 LCA5Q86VQ0 697 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 POMGNT2Q8NAT1 580 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 OR5AK3PQ8NH89 298 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 TUBB1Q9H4B7 451 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 SERHL2Q9H4I8 314 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 ESM1Q9NQ30 184 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 EMCNQ9ULC0 261 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD12-201ENST00000404162 LOC105371242A0A075B767 164 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 CELA3BP08861 270 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 BCKDHAP12694 445 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 COL8A2P25067 703 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 RPS26P62854 115 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35A1P78382 337 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 C3orf36Q3SXR2 165 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 TREML4Q6UXN2 200 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 ZDHHC22Q8N966 263 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 FAM71CQ8NEG0 241 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 CKAP2Q8WWK9 683 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 RACGAP1Q9H0H5 632 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 TREM2Q9NZC2 230 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 A0A096LPE4 126 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PPZ6 126 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM72A0PK05 275 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 VSTM5A8MXK1 200 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 LSM1O15116 133 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 STX11O75558 287 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 GALNTL6Q49A17 601 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 MIDNQ504T8 468 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 EMBQ6PCB8 327 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 ZYG11AQ6WRX3 759 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 LINGO2Q7L985 606 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC126Q96EE4 140 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD27Q96NW4 1050 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 NELFAQ9H3P2 528 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 FIS1Q9Y3D6 152 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 KRT33AO76009 404 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 PNPP00491 289 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00032P0C843 101 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 GAAP10253 952 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 SAGP10523 405 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 MYL2P10916 166 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 MATN1P21941 496 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 PAX7P23759 505 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 HPCAL1P37235 193 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 IDH2P48735 452 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 PLAURQ03405 335 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM99Q8N816 258 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 OR9K2Q8NGE7 335 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 OR51F2Q8NH61 342 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 SFXN5Q8TD22 340 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 SLC6A7Q99884 636 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 SUCNR1Q9BXA5 334 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF350Q9GZX5 532 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHGB4Q9UN71 923 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 TMED7Q9Y3B3 224 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 OR6C65A6NJZ3 312 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV3-15P01624 115 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 TFP02787 698 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 HPXP02790 462 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 SELENOPP49908 381 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 LMO4P61968 165 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP157Q5JU67 520 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 PAQR6Q6TCH4 344 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 HMGN2P46Q86SG4 172 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC4FQ8N1N0 589 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 DDIT4LQ96D03 193 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 G6PC2Q9NQR9 355 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 GIMAP2Q9UG22 337 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 OSGIN1Q9UJX0 560 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 TMED5Q9Y3A6 229 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD12-201ENST00000404162 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80 ms