RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 HSD17B7P56937 341 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5K2Q8NHB8 316 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1W2PR80 420 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 HNF1AP20823 631 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PAX6P26367 422 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 GSK3AP49840 483 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 P2RX1P51575 399 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SUOXP51687 545 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 NCS1P62166 190 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 CXADRP78310 365 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC36A2Q495M3 483 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 OR52N5Q8NH56 324 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MALSU1Q96EH3 234 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 BORCS6Q96GS4 357 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PIGQQ9BRB3 760 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF337Q9Y3M9 751 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 RGPD5Q99666 1765 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAJB1P25685 340 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MICAQ29983 383 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 GDPD3Q7L5L3 318 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 VRK3Q8IV63 474 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 RAB9BQ9NP90 201 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 P2RY10O00398 339 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 KITLGP21583 273 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 DNASE1P24855 282 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 NPSR1Q6W5P4 371 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 TIFABQ6ZNK6 161 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 CCL4L1Q8NHW4 92 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 RAB39BQ96DA2 213 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC106Q9BWC9 280 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ONECUT1Q9UBC0 465 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 GHRLQ9UBU3 117 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF264O43296 627 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 WNT11O96014 354 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SOX18P35713 384 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PCBD1P61457 104 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MGAT3Q09327 533 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM240Q5SV17 173 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 OR14A16Q8NHC5 309 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 LRFN5Q96NI6 719 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ABCG5Q9H222 651 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 EPHX3Q9H6B9 360 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 FETUBQ9UGM5 382 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 EDARQ9UNE0 448 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 NME7Q9Y5B8 376 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 E9PI62 339 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 DHRS13Q6UX07 377 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 OR10X1Q8NGY0 326 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 EGLN2Q96KS0 407 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SELENOIQ9C0D9 397 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 WASH6PQ9NQA3 447 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 RICTORQ6R327 1708 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC30A6NM36 301 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 BAXQ07812 192 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ADPRMQ3LIE5 342 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 TIMD4Q96H15 378 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 POTEKPQ9BYX7 375 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 NLKQ9UBE8 527 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1W2PPE2 198 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1W2PR64 198 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 NPPAP01160 153 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 GAAP10253 952 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 HTR3AP46098 478 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 GABRA4P48169 554 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SUMF1Q8NBK3 374 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 WASH4PA8MWX3 477 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 LEXMQ3ZCV2 418 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 TBPL2Q6SJ96 375 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 FJX1Q86VR8 437 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MINDY1Q8N5J2 469 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC19A3Q9BZV2 496 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SAP130Q9H0E3 1048 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ZBP1Q9H171 429 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC6A20Q9NP91 592 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PPT2Q9UMR5 302 aa11.03□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 RAB3DO95716 219 aa11.02□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ITGB2P05107 769 aa11.02□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 OR10J4P0C629 311 aa11.02□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 OR8G3PP0DMU2 310 aa11.02□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 RACK1P63244 317 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC35A2P78381 396 aa11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms