RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 EXO5Q9H790 373 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 LHX9Q9NQ69 397 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TMEM212A6NML5 194 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FABP7O15540 132 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GIMD1P0DJR0 217 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MAKP20794 623 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RAP2BP61225 183 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ERVK-25P63136 954 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RPTNQ6XPR3 784 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 COMMD2Q86X83 199 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 DOK4Q8TEW6 326 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A36Q96CQ1 311 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 NPIPA5E9PKD4 350 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PEX12O00623 359 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 IMPA2O14732 288 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SCGNO76038 276 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 NKX2-2O95096 273 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CRYZL1O95825 349 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 HLA-DQB1P01920 261 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SRMP19623 302 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 S1PR1P21453 382 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 AGTR1P30556 359 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RIDAP52758 137 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MFSD13AQ14CX5 517 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CDK5R1Q15078 307 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ESCO2Q56NI9 601 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 C5orf46Q6UWT4 87 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ZNF627Q7L945 461 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ZNF681Q96N22 645 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 INTS14Q96SY0 518 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 A0A0B4J2E0 115 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GX12 115 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GABARAPH6UMI1 98 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TNFSF14O43557 240 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FGF17O60258 216 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TFP02787 698 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MT-ND4P03905 459 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SOX2P48431 317 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CEBPEQ15744 281 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 COMMD7Q86VX2 200 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FTMTQ8N4E7 242 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 S100A13Q99584 98 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ALG12Q9BV10 488 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 IL21RQ9HBE5 538 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 NOX3Q9HBY0 568 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 IFT46Q9NQC8 304 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PPM1DO15297 605 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GYPBP06028 91 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PROS1P07225 676 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 THEGLP0DJG4 465 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 NR2C1P13056 603 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GTF2F2P13984 249 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ADAM8P78325 824 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MED30Q96HR3 178 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 A0A0A6YYJ9 748 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TUBAL3A6NHL2 446 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 A6NIZ1 184 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 I3L1I5 382 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF10AO00220 468 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SSX4O60224 188 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RAF1P04049 648 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CD1AP06126 327 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 AKAIN1P0CW23 69 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PSMB10P40306 273 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RAP1BP61224 184 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RAP1AP62834 184 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FCRL6Q6DN72 434 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FAAH2Q6GMR7 532 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FBXO42Q6P3S6 717 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 LMX1AQ8TE12 382 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RDH8Q9NYR8 311 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
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