RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606587.1

AC008972.2-201, humanhuman

BASIC

Gene AC008972.2, Length 494 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008972.2-201ENST00000606587 PIGTQ969N2 578 aa12.01□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 SPDL1Q96EA4 605 aa12.01□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 POTEKPQ9BYX7 375 aa12.01□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 A4GALTQ9NPC4 353 aa12.01□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 CCDC167Q9P0B6 97 aa12.01□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 TMEM181Q9P2C4 612 aa12.01□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 ZANQ9Y493 2812 aa12.01□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 CADP27708 2225 aa12.01□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 A0A0G2JPF8 293 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 ZNF716A6NP11 495 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 C5orf58C9J3I9 102 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 ZNF208O43345 1280 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 IGHV3-9P01782 118 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 THBS1P07996 1170 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 NUDT7P0C024 238 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 COPZ1P61923 177 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 SLC35A1P78382 337 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 FADDQ13158 208 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 SQLEQ14534 574 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 RGNQ15493 299 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 TAB1Q15750 504 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 AGKQ53H12 422 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 GCNT6Q5T4J0 391 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 RNF220Q5VTB9 566 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 P3H2Q8IVL5 708 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 FUNDC1Q8IVP5 155 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 CCDC103Q8IW40 242 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 UBE2J2Q8N2K1 259 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 HSD17B8Q92506 261 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 APH1AQ96BI3 265 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 ARMC7Q9H6L4 198 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 ZNF232Q9UNY5 417 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 USF3Q68DE3 2245 aa12□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 GPR171O14626 319 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 CLOCKO15516 846 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 RAMP1O60894 148 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 PLAUP00749 431 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 PRG2P13727 222 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 IGHV1-2P23083 117 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 CXCR1P25024 350 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 IDUAP35475 653 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 PDK3Q15120 406 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 Q5PR19 223 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 WBP2NLQ6ICG8 309 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 CASP12Q6UXS9 341 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 SERPINA11Q86U17 422 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 CLIP4Q8N3C7 705 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 BBS10Q8TAM1 723 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 PERPQ96FX8 193 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 PIP5K1AQ99755 562 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 SPATA9Q9BWV2 254 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 NGBQ9NPG2 151 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 TRAPPC4Q9Y296 219 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 RNF115Q9Y4L5 304 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 TLN2Q9Y4G6 2542 aa11.99□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 HS3ST1O14792 307 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 ARHGEF9O43307 516 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 CD3EP07766 207 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 IMPDH2P12268 514 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 COX5AP20674 150 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 PPIBP23284 216 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 HOXC12P31275 282 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 ATP4BP51164 291 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 MAP2K6P52564 334 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 SLC16A1P53985 500 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 BNIP2Q12982 314 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 OR7A5Q15622 319 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 ZSWIM7Q19AV6 140 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 ZNF311Q5JNZ3 666 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 LRIF1Q5T3J3 769 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 SHEQ5VZ18 495 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 FBXW9Q5XUX1 488 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 MSRB3Q8IXL7 192 aa11.98□□□□□ -0.49
AC008972.2-201ENST00000606587 NFKBIDQ8NI38 313 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms