RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 RADILQ96JH8 1075 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 OR52E6Q96RD3 313 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 THAP1Q9NVV9 213 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 OSGIN1Q9UJX0 560 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 PRDM4Q9UKN5 801 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 TMED7Q9Y3B3 224 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 PLCE1Q9P212 2302 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 TMEM72A0PK05 275 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 TRPC5OSA6NMA1 111 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 ABCD4O14678 606 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 RAD51DO75771 328 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 IGHV3-9P01782 118 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 IMPDH2P12268 514 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 EPHA3P29320 983 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 SLC1A3P43003 542 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 MAGEA8P43361 318 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 OR2B6P58173 313 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 PPP2R2BQ00005 443 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 EPS8Q12929 822 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 VEZF1Q14119 521 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 COX20Q5RI15 118 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 HHATQ5VTY9 493 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD42Q8N9B4 389 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 DDIT4LQ96D03 193 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 DNAJA3Q96EY1 480 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 MUS81Q96NY9 551 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 FAIMQ9NVQ4 179 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 ASB6Q9NWX5 421 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 TAS2R16Q9NYV7 291 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 SLC25A15Q9Y619 301 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 CR1P17927 2039 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 CFAP73A6NFT4 308 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 PDLIM1O00151 329 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 KRT75O95678 551 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 GSNP06396 782 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 DBIP07108 87 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 IL7RP16871 459 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 TACR3P29371 465 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 MVDP53602 400 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 CDH11P55287 796 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 SLC35A1P78382 337 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 GNA13Q14344 377 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 MAPK11Q15759 364 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 UBE2J2Q8N2K1 259 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 ZBTB18Q99592 522 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 ADAM19Q9H013 955 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 MGAT4BQ9UQ53 548 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 DSPPQ9NZW4 1301 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-206ENST00000588345 CIB4A0PJX0 185 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 TMEM120BA0PK00 339 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 RNF223E7ERA6 249 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 SLCO1B7G3V0H7 640 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 IGHV4-39P01824 125 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 IL6P05231 212 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 ITGA5P08648 1049 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 NR2F1P10589 423 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 IDO1P14902 403 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 UQCRBP14927 111 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 CCNA2P20248 432 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 PTAFRP25105 342 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 ACVR1BP36896 505 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 SLC18A1P54219 525 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 FAPQ12884 760 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 SLC17A1Q14916 467 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 GABRA6Q16445 453 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 GSTA3Q16772 222 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 OR7E24Q6IFN5 339 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 PAQR6Q6TCH4 344 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 TMEM108Q6UXF1 575 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 ZNF440Q8IYI8 595 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 REG4Q9BYZ8 158 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 ALG2Q9H553 416 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 SLC6A13Q9NSD5 602 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 CDHR4A6H8M9 788 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 CCT8L1PA6NM43 557 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 RFXANKO14593 260 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 NDUFS7O75251 213 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 ZCCHC18P0CG32 403 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-206ENST00000588345 ATG16L1Q676U5 607 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms