RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 SERPINA6P08185 405 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 PTNP21246 168 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 COMTP21964 271 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 PRTN3P24158 256 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 PSMB4P28070 264 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 SRD5A2P31213 254 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 IL2RGP31785 369 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 SLC12A2P55011 1212 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 FBXW4P57775 412 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 LINC00310P59036 64 aa4.47□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 BIKQ13323 160 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 TFDP2Q14188 446 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 RCN2Q14257 317 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 KCNJ11Q14654 390 aa4.47□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 MEP1BQ16820 701 aa4.47□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 KLHL38Q2WGJ6 581 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM268Q5VZI3 342 aa4.47□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 CASC4Q6P4E1 433 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 TRIM40Q6P9F5 258 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 LCTLQ6UWM7 567 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 SLC29A4Q7RTT9 530 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 KLBQ86Z14 1044 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 TUSC5Q8IXB3 177 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 RCOR2Q8IZ40 523 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 GABRG1Q8N1C3 465 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 OR52N4Q8NGI2 321 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 FNDC9Q8TBE3 224 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 P3H4Q92791 437 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 CORO2AQ92828 525 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM186Q96B77 213 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 ERGIC2Q96RQ1 377 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 CCT8L2Q96SF2 557 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 HBEGFQ99075 208 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 ATP6V0BQ99437 205 aa4.47□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 NUF2Q9BZD4 464 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 NUAK2Q9H093 628 aa4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
TRIM25-208ENST00000574234 MGAT4BQ9UQ53 548 aa4.47□□□□□ -1.69
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TRIM25-208ENST00000574234 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 BCL10O95999 233 aa4.46□□□□□ -1.7
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TRIM25-208ENST00000574234 NUDT17P0C025 328 aa4.46□□□□□ -1.7
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TRIM25-208ENST00000574234 CDH1P12830 882 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 IL32P24001 234 aa4.46□□□□□ -1.7
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TRIM25-208ENST00000574234 KHKP50053 298 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 BMXP51813 675 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 CTBP2P56545 445 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 CLDN15P56746 228 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 IL1RL1Q01638 556 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 SLC18A2Q05940 514 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 TP53BP2Q13625 1128 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 DOC2AQ14183 400 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 PON3Q15166 354 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 PPA1Q15181 289 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 KRT31Q15323 416 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 CDONQ4KMG0 1287 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 PLAC9Q5JTB6 97 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 LRRC38Q5VT99 294 aa4.46□□□□□ -1.7
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TRIM25-208ENST00000574234 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
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TRIM25-208ENST00000574234 FAM47BQ8NA70 645 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 TSPAN14Q8NG11 270 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 MRAPQ8TCY5 172 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 ANKRD7Q92527 254 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 PYCR2Q96C36 320 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 BIRC8Q96P09 236 aa4.46□□□□□ -1.7
TRIM25-208ENST00000574234 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.46□□□□□ -1.7
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