RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513634.1

ATG10-208, Transcript of autophagy related 10, human

TSL 2 BASIC

Gene ATG10, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG10-208	ENST00000513634	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG10-208	ENST00000513634	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG10-208	ENST00000513634	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG10-208	ENST00000513634	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG10-208	ENST00000513634	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATG10-208	ENST00000513634	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634		A0A0G2JMP0	313 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634		A0A0X1KG70	313 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634		A0A1B0GUS0	222 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634		C9JVG2	144 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	WNT9B	O14905	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	MPZL1	O95297	269 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	YES1	P07947	543 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	CD22	P20273	847 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	S1PR1	P21453	382 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	DRD5	P21918	477 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	SFTPD	P35247	375 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	SERPINF1	P36955	418 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	LIPA	P38571	399 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	PPIC	P45877	212 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	OR3A2	P47893	321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	PRIM2	P49643	509 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	KHK	P50053	298 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	PGGT1B	P53609	377 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	CDKN2D	P55273	166 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	TAF9	Q16594	264 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	STX1A	Q16623	288 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	RNF138	Q8WVD3	245 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	NPAS1	Q99742	590 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	TPK1	Q9H3S4	243 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	PRODH2	Q9UF12	536 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	LYST	Q99698	3801 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	LINC00473	A8K010	186 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634		J3QLI3	93 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	AP3B1	O00203	1094 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	PLPP1	O14494	284 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	PGRMC2	O15173	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	T	O15178	435 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	GYPC	P04921	128 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	ME2	P23368	584 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	XK	P51811	444 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	TERF1	P54274	439 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	RAG2	P55895	527 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	RWDD2B	P57060	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	CARD18	P57730	90 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG10-208	ENST00000513634	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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