RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497425.1

TTC21B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, human

TSL 3

Gene TTC21B, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC21B-208	ENST00000497425	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	ALLC	Q8N6M5	410 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	SHC3	Q92529	594 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	UBE2E3	Q969T4	207 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	TIMD4	Q96H15	378 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	B3GALT6	Q96L58	329 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	NICN1	Q9BSH3	213 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	RAB34	Q9BZG1	259 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	PRR34	Q9NV39	138 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	HYPK	Q9NX55	129 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	CD274	Q9NZQ7	290 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425		A0A1B0GVL5	298 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	HIP1	O00291	1037 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	DCTN6	O00399	190 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	MED7	O43513	233 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	TIMP1	P01033	207 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	IGHV3-48	P01763	117 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	HTR1F	P30939	366 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	CCR1	P32246	355 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	PTGDS	P41222	190 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	BTD	P43251	543 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	RGR	P47804	291 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	ATP1B3	P54709	279 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	RIPPLY3	P57055	190 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF45	Q02386	682 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	KLRB1	Q12918	225 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	GRB7	Q14451	532 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	UQCC3	Q6UW78	93 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	VRK2	Q86Y07	508 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	C10orf35	Q96D05	121 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	CLCC1	Q96S66	551 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	RNF2	Q99496	336 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	COPS8	Q99627	209 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	RBKS	Q9H477	322 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	REEP4	Q9H6H4	257 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	MARCH5	Q9NX47	278 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	TREM2	Q9NZC2	230 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	COPS3	Q9UNS2	423 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	IFT52	Q9Y366	437 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	ASB3	Q9Y575	518 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	HDAC3	O15379	428 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	NBR2	O15453	112 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	MBTPS2	O43462	519 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	PRKAB2	O43741	272 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	FCMR	O60667	390 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	RAMP3	O60896	148 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	STAMBP	O95630	424 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	LGI1	O95970	557 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	CALCR	P30988	508 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	CSNK1G2	P78368	415 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	PLD1	Q13393	1074 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	VGLL4	Q14135	290 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	HSDL2	Q6YN16	418 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	PGAP1	Q75T13	922 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	FTMT	Q8N4E7	242 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	FAM110B	Q8TC76	370 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	PAGE5	Q96GU1	130 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	SEC22A	Q96IW7	307 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	TECTB	Q96PL2	329 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTC21B-208	ENST00000497425	SMIM14	Q96QK8	99 aa		2.68	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms