RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 MEIOCA2RUB1 952 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 METTL15A6NJ78 407 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 LAMP1P11279 417 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 F2RP25116 425 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RAB13P51153 203 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RAC1P63000 192 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 OLIG2Q13516 323 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 OR6V1Q8N148 313 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 DTX3Q8N9I9 347 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 GJD2Q9UKL4 321 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ANGPTL7O43827 346 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 GJB5O95377 273 aa6.25□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 IMPA1P29218 277 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 PSMB3P49720 205 aa6.25□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 C1orf61Q13536 156 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 GPR19Q15760 415 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 EID2Q8N6I1 236 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SYT17Q9BSW7 474 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 YKT6O15498 198 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 FADS1O60427 444 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 APOA2P02652 100 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ACP2P11117 423 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 MTHFD2P13995 350 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 TBPP20226 339 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RAB33AQ14088 237 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SLC15A4Q8N697 577 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 HRH4Q9H3N8 390 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 CA14Q9ULX7 337 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.25□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 GIFP27352 417 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 OPRL1P41146 370 aa6.25□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 ACSM1Q08AH1 577 aa6.25□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 NAGSQ8N159 534 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 OR2T27Q8NH04 317 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 FAM3CQ92520 227 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.25□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 TMEM82A0PJX8 343 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 TNFRSF10AO00220 468 aa6.25□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 AKR1C1Q04828 323 aa6.25□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 ZNF566Q969W8 418 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 APOOQ9BUR5 198 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 NFS1Q9Y697 457 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 WASH4PA8MWX3 477 aa6.25□□□□□ -1.41
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