RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 FAM81AQ8TBF8 368 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 GPA33Q99795 319 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 OR52D1Q9H346 318 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 DSN1Q9H410 356 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MED11Q9P086 117 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL21Q9UJP4 597 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TRAPPC4Q9Y296 219 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF292O60281 2723 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 DMDP11532 3685 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 FRYLO94915 3013 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 GJE1A6NN92 205 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ENO4A6NNW6 628 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CLCA1A8K7I4 914 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 NPIPB7O75200 414 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 AHSA1O95433 338 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 NTN1O95631 604 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 IFNGP01579 166 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 CELA2AP08217 269 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TSPAN19P0C672 248 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PIPP12273 146 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 GABRB1P18505 474 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ELK4P28324 431 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 EPHA2P29317 976 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 GPR4P46093 362 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MASP1P48740 699 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZP4Q12836 540 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF74Q16587 644 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFAF6Q330K2 333 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 RNLSQ5VYX0 342 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 DESI1Q6ICB0 168 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 KIF18BQ86Y91 864 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SVOPQ8N4V2 548 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SCAIQ8N9R8 606 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 PFN4Q8NHR9 129 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM163Q8TC26 289 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 UBQLN3Q9H347 655 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF226Q9NYT6 803 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 LRFN1Q9P244 771 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 DKK4Q9UBT3 224 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 RNF6Q9Y252 685 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 MED13Q9UHV7 2174 aa8.71□□□□□ -1.01
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SLC1A7O00341 560 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 CDC42EP2O14613 210 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SEC14L5O43304 696 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SUSD5O60279 629 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 OR6A2O95222 327 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 CH25HO95992 272 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 ASAH2BP0C7U1 165 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 CD46P15529 392 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF17P17021 662 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 PAICSP22234 425 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 DPP4P27487 766 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SRD5A2P31213 254 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 CD96P40200 585 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 CENPAP49450 140 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 FOXK2Q01167 660 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 MVKQ03426 396 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 EGR4Q05215 589 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SELENBP1Q13228 472 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 TUBA3CQ13748 450 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 PGGHGQ32M88 737 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 PLPPR5Q32ZL2 321 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf140Q5VVS0 124 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 ACSM5Q6NUN0 579 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF773Q6PK81 442 aa8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms