RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	BEST3	Q8N1M1	668 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF566	Q969W8	418 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	GNRHR2	Q96P88	292 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	NANS	Q9NR45	359 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	CLN6	Q9NWW5	311 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300		A6NL46	340 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	SUSD5	O60279	629 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	HCN1	O60741	890 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	LIPC	P11150	499 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	PRKCA	P17252	672 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	NOS3	P29474	1203 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	MASP1	P48740	699 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC35A2	P78381	396 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF773	Q6PK81	442 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	RNF138	Q8WVD3	245 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM234	Q8WY98	164 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	TEX12	Q9BXU0	123 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	MED17	Q9NVC6	651 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300	MGA	Q8IWI9	3026 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RAD9B-204	ENST00000409300		A6NHS1	94 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PTP4A3	O75365	173 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TUBA4A	P68366	448 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	FOXK1	P85037	733 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	MVK	Q03426	396 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PGGHG	Q32M88	737 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	RTL4	Q6ZR62	310 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TAAR8	Q969N4	342 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	COPS4	Q9BT78	406 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM72	A0PK05	275 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM183A	A6NL82	134 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	CLCA1	A8K7I4	914 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300		H3BML4	177 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	NKX2-8	O15522	239 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	OPN1LW	P04000	364 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	CYB561	P49447	251 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	GPR85	P60893	370 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	FOXF1	Q12946	379 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	FHL1	Q13642	323 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF74	Q16587	644 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SPART	Q8N0X7	666 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	DUSP21	Q9H596	190 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	ARGFX	A6NJG6	315 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	BHLHE40	O14503	412 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SURF4	O15260	269 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SERPINI2	O75830	405 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	OR7A10	O76100	309 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PPP1R3D	O95685	299 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SPINK2	P20155	84 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	GABARAPL2	P60520	117 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	LTB	Q06643	244 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SNTA1	Q13424	505 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SYT14P1	Q58G82	188 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SPINK14	Q6IE38	97 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC39A7	Q92504	469 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	GGH	Q92820	318 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	SGCZ	Q96LD1	299 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RAD9B-204	ENST00000409300	PROK2	Q9HC23	129 aa		10.2	□□□□□ -0.78

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