RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 LAMTOR5O43504 91 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 STK17BO94768 372 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MPIG6BO95866 241 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CD70P32970 193 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RAP2BP61225 183 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GPR176Q14439 515 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HMGN3Q15651 99 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZSR9 355 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TCEAL8Q8IYN2 117 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CDRT4Q8N9R6 151 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NTMT1Q9BV86 223 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 B4DXG7 233 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FAM227AF5H4B4 570 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TNFRSF10AO00220 468 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OIP5O43482 229 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GASTP01350 101 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RHOP08100 348 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 UBBP0CG47 229 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MC3RP41968 323 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RGRP47804 291 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 EFNA3P52797 238 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HBA1P69905 142 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GLO1Q04760 184 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 DSC1Q08554 894 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CD163Q86VB7 1156 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLC35F2Q8IXU6 374 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CHST14Q8NCH0 376 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GPR26Q8NDV2 337 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 BBS1Q8NFJ9 593 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NANPQ8TBE9 248 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLC7A6Q92536 515 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CREBZFQ9NS37 354 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 KLHL42Q9P2K6 505 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SCML1Q9UN30 329 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NPIPA7E9PJI5 369 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SEC14L5O43304 696 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF217O75362 1048 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GJB3O75712 270 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OLFM2O95897 454 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NPIPA8P0DM63 369 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLC2A5P22732 501 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HTR3AP46098 478 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ACTBL2Q562R1 376 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR56B4Q8NH76 319 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SFXN2Q96NB2 322 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RFXAPO00287 272 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TNFSF12O43508 249 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NUDT1P36639 197 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 IL13RA1P78552 427 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SYPL1Q16563 259 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SH2D5Q6ZV89 423 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FCRLAQ7L513 359 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR2T11Q8NH01 316 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM239Q8WW34 195 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MED30Q96HR3 178 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MACROD1Q9BQ69 325 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PELI2Q9HAT8 420 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF286AQ9HBT8 521 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FZD7O75084 574 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FBXO24O75426 580 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF28P17035 718 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 JUNDP17535 347 aa8.29□□□□□ -1.08
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