RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 OSGIN1Q9UJX0 560 aa11.35□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 B4E171 279 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 C9J4A7 227 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 ZFAND5O76080 213 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 NUDT14O95848 222 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 INHBBP09529 407 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 GP1BBP13224 206 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 SLC2A5P22732 501 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 NOS3P29474 1203 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 ATP6V1E1P36543 226 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 RPL4P36578 427 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 TSPAN7P41732 249 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 P2RX1P51575 399 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 EGR4Q05215 589 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 CBFBQ13951 182 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 KLHL12Q53G59 568 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 ARMC4Q5T2S8 1044 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 B3GLCTQ6Y288 498 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 PSD4Q8NDX1 1056 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 OR51G2Q8NGK0 314 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 JAM3Q9BX67 310 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 PLGRKTQ9HBL7 147 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 NDUFB11Q9NX14 153 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 LAMA1P25391 3075 aa11.34□□□□□ -0.59
ZNF548-201ENST00000336128 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 GPX5O75715 221 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 PAICSP22234 425 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 SERPINB10P48595 397 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 RPS7P62081 194 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 LTBQ06643 244 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 TMED1Q13445 227 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 PCOLCEQ15113 449 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 QPRTQ15274 297 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 LHFPL3Q86UP9 236 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 MISPQ8IVT2 679 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 CYB561A3Q8NBI2 242 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 OR52E2Q8NGJ4 325 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 MOSPD2Q8NHP6 518 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 LIPHQ8WWY8 451 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 GATAD2BQ8WXI9 593 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 MOGAT1Q96PD6 335 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 OR51V1Q9H2C8 321 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 MMP25Q9NPA2 562 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 ISYNA1Q9NPH2 558 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 SEC14L4Q9UDX3 406 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 KLHL21Q9UJP4 597 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 EXPH5Q8NEV8 1989 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 SLC22A31A6NKX4 558 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 J3QRE1 110 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 UMODP07911 640 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 CD59P13987 128 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 CPEP16870 476 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 CXCR1P25024 350 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 TUBA1BP68363 451 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC157Q569K6 752 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 POMZP3Q6PJE2 187 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 TUBA1AQ71U36 451 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 PHC2Q8IXK0 858 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 SDR9C7Q8NEX9 313 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 OR4K13Q8NH42 304 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 GPR119Q8TDV5 335 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 DUSP19Q8WTR2 217 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 TMCO6Q96DC7 493 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 CMKLR1Q99788 373 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF649Q9BS31 505 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 ERVK13-1Q9NX77 482 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 LOXL2Q9Y4K0 774 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 KMT2EQ8IZD2 1858 aa11.33□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 TSPAN19P0C672 248 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 CLUP10909 449 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 NAGAP17050 411 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 OPRL1P41146 370 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 AQP2P41181 271 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 SLC16A1P53985 500 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 PRPS1P60891 318 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 ERVK-25P63136 954 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 COL28A1Q2UY09 1125 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF548-201ENST00000336128 LIPKQ5VXJ0 399 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms