RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 HRASLS5Q96KN8 279 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 HHATLQ9HCP6 504 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PTTG3PQ9NZH4 202 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 H0YAE9 185 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF4P78317 190 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SEMA3BQ13214 749 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ILKQ13418 452 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ZBED5Q49AG3 693 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 VWA2Q5GFL6 755 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 CTSL3PQ5NE16 218 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MARCH8Q5T0T0 291 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ELP2Q6IA86 826 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PODNL1Q6PEZ8 512 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ST7LQ8TDW4 575 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 CHTF18Q8WVB6 975 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 RANBP9Q96S59 729 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 EHFQ9NZC4 300 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PPP6CO00743 305 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 DENRO43583 198 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 CDK2P24941 298 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 S100A12P80511 92 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC14A1Q13336 389 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ISCA2Q86U28 154 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MYADMQ96S97 322 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MGLLQ99685 303 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SGPP1Q9BX95 441 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 CD320Q9NPF0 282 aa11.06□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 C4orf47A7E2U8 309 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ALDH3B1P43353 468 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 KLHDC9Q8NEP7 349 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4A16Q8NH70 328 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF480Q8WV37 535 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 BTBD2Q9BX70 525 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 TSPAN15O95858 294 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 VN1R2Q8NFZ6 395 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 RHEBL1Q8TAI7 183 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 EMC6Q9BV81 110 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 WDR76Q9H967 626 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 NOX3Q9HBY0 568 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MYNNQ9NPC7 610 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1W2PPV4 95 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP6AP1Q15904 470 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PAGE3Q5JUK9 113 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 TFAP2CQ92754 450 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 P2RY12Q9H244 342 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 UBQLN4Q9NRR5 601 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 FAIMQ9NVQ4 179 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MYOTQ9UBF9 498 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC42Q9Y546 428 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 AKR7A3O95154 331 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 GM2AP17900 193 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 F2RL1P55085 397 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 IL34Q6ZMJ4 242 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 FBXW5Q969U6 566 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 LOXL2Q9Y4K0 774 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 WBP2NLQ6ICG8 309 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SPARTQ8N0X7 666 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 OR2I1PQ8NGU4 316 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIB3Q96RU7 358 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ACPTQ9BZG2 426 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 QPCTLQ9NXS2 382 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 STEAP1Q9UHE8 339 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 TNFSF11O14788 317 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MT-ND4P03905 459 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP1B3P54709 279 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 CLDN12P56749 244 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 TRAM1Q15629 374 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 HSD3B7Q9H2F3 369 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PLSCR3Q9NRY6 295 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SPHK1Q9NYA1 384 aa11.05□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MT-CO2P00403 227 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF813Q6ZN06 617 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4F15Q8NGB8 312 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 HAS2Q92819 552 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 MIB2Q96AX9 1013 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 SHISA4Q96DD7 197 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 CRLF2Q9HC73 371 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 PLA2G3Q9NZ20 509 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 KLHL33A6NCF5 533 aa11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
UBASH3B-201ENST00000284273 ADH6P28332 368 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms