RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 SCGNO76038 276 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MYBPHQ13203 477 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 RSU1Q15404 277 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SAXO2Q658L1 398 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 GALNT16Q8N428 558 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ZNF611Q8N823 705 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 NAXEQ8NCW5 288 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 OR5J2Q8NH18 312 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 M1APQ8TC57 530 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 F5H5K5 113 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CD3GP09693 182 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PRPH2P23942 346 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 RUNX2Q13950 521 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SLC6A19Q695T7 634 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 FBXO27Q8NI29 283 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 COG8Q96MW5 612 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 OR52D1Q9H346 318 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MARCH7Q9H992 704 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 INPP5EQ9NRR6 644 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CTSFQ9UBX1 484 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SLC16A7O60669 478 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 B3GALT4O96024 378 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 DRD5P21918 477 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 FKRPQ9H9S5 495 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CHP2O43745 196 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TMPRSS11DO60235 418 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PYCR1P32322 319 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 POU3F4P49335 361 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ST3GAL4Q11206 333 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CCDC107Q8WV48 283 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 GAL3ST1Q99999 423 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 DDA1Q9BW61 102 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ABCB9Q9NP78 766 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 FBXO8Q9NRD0 319 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SPATA2Q9UM82 520 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 A0A1B0GWA3 101 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TNFRSF1BP20333 461 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MMP11P24347 488 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SLC1A3P43003 542 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 GPR85P60893 370 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 GMFBP60983 142 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TUBA1BP68363 451 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TUBA4AP68366 448 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MC2RQ01718 297 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TSPAN31Q12999 210 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TCTN3Q6NUS6 607 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TUBA1AQ71U36 451 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 OR5AK2Q8NH90 309 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 C16orf52Q8NHV5 167 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ENY2Q9NPA8 101 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SDK1Q7Z5N4 2213 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 A0A0A6YYD5 115 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 FAM25EA8MYX2 175 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SELEP16581 610 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 HTR5AP47898 357 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 DUSP5Q16690 384 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 BORAQ6PGQ7 559 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.37□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MED17Q9NVC6 651 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms