RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF544Q6NX49 715 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 PIGXQ8TBF5 258 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 AGR3Q8TD06 166 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 C10orf105Q8TEF2 133 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 ARL5BQ96KC2 179 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 MUS81Q96NY9 551 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 RHOXF2Q9BQY4 288 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 INPP5KQ9BT40 448 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 DUSP26Q9BV47 211 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC106Q9BWC9 280 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 BEX2Q9BXY8 128 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 MKS1Q9NXB0 559 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 MKLN1Q9UL63 735 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 PDLIM1O00151 329 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR171O14626 319 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD28O15084 1053 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 DNPH1O43598 174 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA0513O60268 411 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 CSF3P09919 207 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 USF1P22415 310 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 THBS2P35442 1172 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 PGM1P36871 562 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 EFNA4P52798 201 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 MAPK14Q16539 360 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 CYB5R2Q6BCY4 276 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC103Q8IW40 242 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 CLECL1Q8IZS7 167 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 PROX1Q92786 737 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJA3Q96EY1 480 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 APOPT1Q96IL0 206 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC35G5Q96KT7 338 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 MECRQ9BV79 373 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 SHARPINQ9H0F6 387 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 CTPS2Q9NRF8 586 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.962e-6■■■■□ 23
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 LMX1BO60663 402 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 GUSBP08236 651 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 G6PDP11413 515 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 BMP4P12644 408 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 ARRB2P32121 409 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGEA8P43361 318 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 CLK1P49759 484 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 H3F3AP84243 136 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 PGS1Q32NB8 556 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 EMBQ6PCB8 327 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 CASP12Q6UXS9 341 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 C16orf62Q7Z3J2 963 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 GRINAQ7Z429 371 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 ADGRG3Q86Y34 549 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 CLEC4FQ8N1N0 589 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 C17orf78Q8N4C9 275 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR31Q8NA23 367 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF563Q8TA94 476 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 MIPOL1Q8TD10 442 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 OIT3Q8WWZ8 545 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 OR11A1Q9GZK7 315 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 OR51I1Q9H343 314 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 FKRPQ9H9S5 495 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 EXD2Q9NVH0 621 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 AMDHD2Q9Y303 409 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-226ENST00000593200 VWC2LB2RUY7 222 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 LY6HO94772 140 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 AGR2O95994 175 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 IGFBP5P24593 272 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms