RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 KIAA0040Q15053 153 aa15.53■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.53■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 GLCCI1Q86VQ1 547 aa15.53■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa15.53■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 OR56A1Q8NGH5 318 aa15.53■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 CLHC1Q8NHS4 586 aa15.53■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF563Q8TA94 476 aa15.53■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 DNAJA3Q96EY1 480 aa15.53■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa15.53■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa15.53■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 SERINC4A6NH21 518 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM157AC9JC47 383 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 TRIM77I1YAP6 450 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 PDLIM1O00151 329 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 ANKRD28O15084 1053 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 LILRA1O75019 489 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 SLU7O95391 586 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 CSTAP01040 98 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 IFNGR1P15260 489 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 PRPH2P23942 346 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 MPGP29372 298 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 NTF4P34130 210 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 CCT3P49368 545 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 OR2B6P58173 313 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 LGALS3BPQ08380 585 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 ZSWIM7Q19AV6 140 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 CFAP157Q5JU67 520 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 RELL1Q8IUW5 271 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 CCDC103Q8IW40 242 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 MTERF3Q96E29 417 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 SAP130Q9H0E3 1048 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 TSPYL1Q9H0U9 437 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 PLK3Q9H4B4 646 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC7A10Q9NS82 523 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 ACER3Q9NUN7 267 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 CHRNA9Q9UGM1 479 aa15.52■□□□□ 0.08
TSPAN3-204ENST00000558394 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa15.52■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 TMEM89A2RUT3 159 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 ESPNB1AK53 854 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 B4DSR2 109 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 NPIPB8E9PQR5 432 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 NPIPB9F8W1W9 429 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 KLF11O14901 512 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 UROSP10746 265 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 SDC1P18827 310 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 PAX7P23759 505 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 HPCAL1P37235 193 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 ASMTP46597 345 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 RPL38P63173 70 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 SKP2Q13309 424 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 PDE7AQ13946 482 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 CCNIQ14094 377 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 GPR68Q15743 365 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 EFNB3Q15768 340 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 ADIPOQQ15848 244 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 DEF8Q6ZN54 512 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 WDR60Q8WVS4 1066 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC38A2Q96QD8 506 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 KATNB1Q9BVA0 655 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 OBP2BQ9NPH6 170 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 KRT33AO76009 404 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 MYL2P10916 166 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 TSPO2Q5TGU0 170 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 C8orf74Q6P047 294 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 TIFABQ6ZNK6 161 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF786Q8N393 782 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM216AQ8WUB2 273 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 ARL5BQ96KC2 179 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 JMJD8Q96S16 334 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 NMUR2Q9GZQ4 415 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 DYNLRB1Q9NP97 96 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 CTPS2Q9NRF8 586 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 PCDHB10Q9UN67 800 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 CCL27Q9Y4X3 112 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 KCNE3Q9Y6H6 103 aa15.5■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa15.49■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 NEFHP12036 1026 aa15.49■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 RPL3P39023 403 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 CLK1P49759 484 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 HIKESHIQ53FT3 197 aa15.49■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 FRMD7Q6ZUT3 714 aa15.49■□□□□ 0.07
TSPAN3-204ENST00000558394 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms