RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	FES	P07332	822 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	YES1	P07947	543 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	GKN3P	P0CG01	181 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD53	P19397	219 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP4B	P51164	291 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSC22D1	Q15714	1073 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	BEND4	Q6ZU67	534 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAL2	Q969L2	176 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPDL1	Q96EA4	605 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAM19	Q9H013	955 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	VAPA	Q9P0L0	249 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	GMEB1	Q9Y692	573 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFAP73	A6NFT4	308 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF724	A8MTY0	619 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	SULT2B1	O00204	365 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	NR5A2	O00482	541 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	CASK	O14936	926 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	PMS2P2	O95744	297 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAF1	P04049	648 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	IMPDH2	P12268	514 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRG2	P13727	222 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL7R	P16871	459 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNASE1	P24855	282 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	TACR3	P29371	465 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC1A3	P43003	542 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR3A2	P47893	321 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRISP3	P54108	245 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	H3F3A	P84243	136 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF220	Q5VTB9	566 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	COMTD1	Q86VU5	262 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR10A4	Q9H209	315 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS50	Q9UI38	385 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0G2JPF8	293 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	THBS1	P07996	1170 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP3CB	P16298	524 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCNA2	P20248	432 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	STX1B	P61266	288 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	FADD	Q13158	208 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	SQLE	Q14534	574 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDK3	Q15120	406 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	AGK	Q53H12	422 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	STK32C	Q86UX6	486 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC103	Q8IW40	242 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	S100PBP	Q96BU1	408 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP2-222	ENST00000512014	CALML5	Q9NZT1	146 aa		11.26	□□□□□ -0.61

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