RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492440.1

TTLL3-229, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 1,549 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-229ENST00000492440 LIMS3P0CW19 117 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 LIMS4P0CW20 117 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 CPEP16870 476 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 NAGAP17050 411 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 ACP1P24666 158 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 PRPS1P60891 318 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 MC2RQ01718 297 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 ZNF117Q03924 483 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 ACSM1Q08AH1 577 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 TPBGQ13641 420 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 OR52N1Q8NH53 320 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 S100ZQ8WXG8 99 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 LPAR4Q99677 370 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 SH3GL3Q99963 347 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 APMAPQ9HDC9 416 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 INPP5EQ9NRR6 644 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 CDC14CA4D256 554 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 IDH3BO43837 385 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 PPP1R3DO95685 299 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 PGCP20142 388 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 PAICSP22234 425 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 MST1P26927 711 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 MPLP40238 635 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 CCR4P51679 360 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 BMXP51813 675 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 ITGADQ13349 1161 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 PHC2Q8IXK0 858 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 AMER2Q8N7J2 671 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 SLC37A3Q8NCC5 494 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 OR5W2Q8NH69 310 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 ZNF649Q9BS31 505 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 CRB3Q9BUF7 120 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 STUB1Q9UNE7 303 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 METTL15A6NJ78 407 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 HCRTR2O43614 444 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 GPX5O75715 221 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 SLC2A5P22732 501 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 EVI2BP34910 448 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 SLC26A5P58743 744 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 ZNF74Q16587 644 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 ZNF563Q8TA94 476 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 PTP4A1Q93096 173 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 CENPOQ9BU64 300 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 MMP27Q9H306 513 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-229ENST00000492440 CCDC182A6NF36 153 aa14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-229ENST00000492440 FAM183AA6NL82 134 aa14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-229ENST00000492440 CLDN25C9JDP6 229 aa14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-229ENST00000492440 GNB5O14775 395 aa14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-229ENST00000492440 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-229ENST00000492440 FLRT2O43155 660 aa14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-229ENST00000492440 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-229ENST00000492440 OPRL1P41146 370 aa14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-229ENST00000492440 SOX3P41225 446 aa14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-229ENST00000492440 P2RX1P51575 399 aa14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-229ENST00000492440 BDH1Q02338 343 aa14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-229ENST00000492440 POU4F2Q12837 409 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms