RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCN1AP35498 2009 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 CPED1A4D0V7 1026 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF222A6NCQ9 220 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 A8MXE2 369 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNQ2O43526 872 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 CA11O75493 328 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 GLCEO94923 617 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 DIRAS3O95661 229 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 TXNDC12O95881 172 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 FGBP02675 491 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOD3P08294 240 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR4E1P0C645 316 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACP2P11117 423 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 CKBP12277 381 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 SDC1P18827 310 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 GDF5P43026 501 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 GSK3AP49840 483 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 NRG3P56975 720 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 SHC2P98077 582 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 PITPNAQ00169 270 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 TWF1Q12792 350 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 DNLZQ5SXM8 178 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACBD6Q9BR61 282 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 DDA1Q9BW61 102 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 MMP26Q9NRE1 261 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 LANCL2Q9NS86 450 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASB6Q9NWX5 421 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 CENPFP49454 3210 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHOX2AO14813 284 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNAB3O43448 404 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAFKO60675 156 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 EFCAB14O75071 495 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 SH3BGRLO75368 114 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 IL18BPO95998 194 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 AK1P00568 194 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 BCHEP06276 602 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 THBS1P07996 1170 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTHLHP12272 177 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 CSF2RAP15509 400 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 ST6GAL1P15907 406 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 APLNRP35414 380 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADIGQ0VDE8 80 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 GAGE1Q13065 139 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 TDGQ13569 410 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNMB1Q16558 191 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 MESTQ5EB52 335 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 LIN54Q6MZP7 749 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 COMTD1Q86VU5 262 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 WNT8BQ93098 351 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACPTQ9BZG2 426 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM100Q9NV29 134 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARL5AQ9Y689 179 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 RLFQ13129 1914 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF13O43567 381 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLHL18O94889 574 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCGF2P35227 344 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 TDGF1P3P51864 188 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 LIM2P55344 173 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOX8P57073 446 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 EFNB1P98172 346 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB40BQ12829 278 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 COX20Q5RI15 118 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 SYT9Q86SS6 491 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms