RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 UBQLNLQ8IYU4 475 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 GVQW1Q8N7I0 195 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 STPG4Q8N801 248 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 C9orf106Q8NAJ2 232 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 NANPQ8TBE9 248 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNRF4Q8WWF5 429 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 PSMG2Q969U7 264 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 DUX5Q96PT3 197 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 NPAS2Q99743 824 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC00597Q9H2U6 94 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 FN3KRPQ9HA64 309 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 MBD2Q9UBB5 411 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CRLS1Q9UJA2 301 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 AP4B1Q9Y6B7 739 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CACNA1CQ13936 2221 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 FER1L5A0AVI2 2057 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 LOC105371242A0A075B767 164 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM47DPA6NHR8 397 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF716A6NP11 495 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 H0Y8G0 127 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CLDN5O00501 218 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF195O14628 629 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CYTH3O43739 400 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TOXO94900 526 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 OAZ2O95190 189 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHEP01854 428 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF735P0CB33 412 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 GZMAP12544 262 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF44P15621 663 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 QARSP47897 775 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ZP4Q12836 540 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF77Q15935 545 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ISXQ2M1V0 245 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 GTDC1Q4AE62 458 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM150AQ86TG1 271 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 VSTM4Q8IW00 320 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 NIPA2Q8N8Q9 360 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4F17Q8NGA8 305 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4D10Q8NGI6 311 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4F5Q8NH21 305 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 LMO3Q8TAP4 145 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TM9SF4Q92544 642 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 GIMAP5Q96F15 307 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 MED30Q96HR3 178 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CPB2Q96IY4 423 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 PRAC1Q96KF2 57 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4F4Q96R69 305 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM43Q9BTV4 400 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM9Q9C026 710 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 NRN1Q9NPD7 142 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 EMCNQ9ULC0 261 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF215Q9Y6U7 377 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.73□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 RYR3Q15413 4870 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 HEATR9A2RTY3 570 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 HELTA6NFD8 242 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 MYMKA6NI61 221 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 K7EM74 188 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 SURF4O15260 269 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNAB3O43448 404 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 MED7O43513 233 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 DFNA5O60443 496 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 B3GAT3O94766 335 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TNFSF15O95150 251 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CLPTM1O96005 669 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 OAS1P00973 400 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 APODP05090 189 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC35G4P0C7Q5 338 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 UQCRBP14927 111 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CD1EP15812 388 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 SELEP16581 610 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 EDNRAP25101 427 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 NMT1P30419 496 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CCR1P32246 355 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 GRIA1P42261 906 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 PGFP49763 221 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP10-9P60411 292 aa4.72□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms